- u -

• uint16_to_real() : protocols::motif_hash
• uint8_to_real() : protocols::motif_hash
• unfold_complex() : protocols::protein_interface_design::movers
• uniform_dof_distribution() : protocols::simple_moves
• union_interval() : protocols::forge::methods
• universal_main() : protocols::jobdist
• update_allow_insert_with_extra_minimize_res() : protocols::stepwise::sampling::rna
• update_atom_map() : protocols::hybridization
• update_edge_hbond_numbers() : protocols::farna
• update_edge_hbond_numbers_careful_hydrogen() : protocols::farna
• update_sequence_separation() : protocols::star
• upstream_centroid_by_jump() : protocols::geometry