core::scoring::sasa::SasaCalc Member List

This is the complete list of members for core::scoring::sasa::SasaCalc, including all inherited members.

atom_sasa_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
atom_subset_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
big_polar_h_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
calc_per_res_sasas(const pose::Pose &pose)	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
calculate(const pose::Pose &pose)	core::scoring::sasa::SasaCalc
calculate(const pose::Pose &pose, id::AtomID_Map< Real > &atom_sasa)	core::scoring::sasa::SasaCalc
calculate(const pose::Pose &pose, utility::vector1< Real > &rsd_sasa, utility::vector1< Real > &rsd_hsasa)	core::scoring::sasa::SasaCalc
calculate(const pose::Pose &pose, id::AtomID_Map< Real > &atom_sasa, utility::vector1< Real > &rsd_sasa, utility::vector1< Real > &rsd_hsasa)	core::scoring::sasa::SasaCalc
calculate(const pose::Pose &pose, id::AtomID_Map< Real > &atom_sasa, utility::vector1< Real > &rsd_sasa, utility::vector1< Real > &rsd_hsasa, utility::vector1< Real > &rsd_rel_hsasa)	core::scoring::sasa::SasaCalc
exclude_polar_all_in_hsasa_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
explicit_radii_set_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
fill_data(Real &total_hsasa, Real &total_rel_hsasa, id::AtomID_Map< Real > &atom_sasa, utility::vector1< Real > &rsd_sasa, utility::vector1< Real > &rsd_hsasa, utility::vector1< Real > &rel_hsasa)	core::scoring::sasa::SasaCalc
get_atom_sasa() const	core::scoring::sasa::SasaCalc	inline
get_rel_hphobic_sasa_by_charge() const	core::scoring::sasa::SasaCalc	inline
get_residue_hsasa() const	core::scoring::sasa::SasaCalc	inline
get_residue_hsasa_bb() const	core::scoring::sasa::SasaCalc
get_residue_hsasa_sc() const	core::scoring::sasa::SasaCalc	inline
get_residue_sasa() const	core::scoring::sasa::SasaCalc	inline
get_residue_sasa_bb() const	core::scoring::sasa::SasaCalc
get_residue_sasa_sc() const	core::scoring::sasa::SasaCalc	inline
get_total_hsasa() const	core::scoring::sasa::SasaCalc	inline
get_total_hsasa_bb() const	core::scoring::sasa::SasaCalc	inline
get_total_hsasa_sc() const	core::scoring::sasa::SasaCalc	inline
get_total_rel_hsasa() const	core::scoring::sasa::SasaCalc	inline
get_total_sasa() const	core::scoring::sasa::SasaCalc	inline
get_total_sasa_bb() const	core::scoring::sasa::SasaCalc	inline
get_total_sasa_sc() const	core::scoring::sasa::SasaCalc	inline
implicit_radii_set_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
include_c_s_only_in_hsasa_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
include_hydrogens_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
include_probe_radius_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
init(const pose::Pose &pose)	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
method_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
method_type_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
polar_charge_cutoff_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
probe_radius_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
rel_hydrophobic_sasa_by_charge_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
rsd_hsasa_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
rsd_hsasa_sc_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
rsd_sasa_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
rsd_sasa_sc_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
sasa_method_hp_mode() const	core::scoring::sasa::SasaCalc	inline
sasa_method_hp_mode_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
SasaCalc()	core::scoring::sasa::SasaCalc
SasaCalc(SasaMethodEnum method)	core::scoring::sasa::SasaCalc
set_calculation_method(SasaMethodEnum method)	core::scoring::sasa::SasaCalc
set_defaults()	core::scoring::sasa::SasaCalc
set_exclude_polar_atoms_by_charge(bool exclude_polar_all)	core::scoring::sasa::SasaCalc
set_explicit_hydrogen_included_radii_set(SasaRadii radii_set)	core::scoring::sasa::SasaCalc
set_implicit_hydrogen_included_radii_set(SasaRadii radii_set)	core::scoring::sasa::SasaCalc
set_include_carbon_sulfer_only_in_hydrophobic_calc(bool include_c_s_only)	core::scoring::sasa::SasaCalc
set_include_hydrogens_explicitly(bool include_hydrogens)	core::scoring::sasa::SasaCalc
set_include_probe_radius_in_atom_radii(bool include_probe_radius)	core::scoring::sasa::SasaCalc
set_polar_charge_cutoff(Real cutoff)	core::scoring::sasa::SasaCalc
set_probe_radius(Real probe_radius)	core::scoring::sasa::SasaCalc
set_sasa_method_hp_mode(SasaMethodHPMode const mode_in)	core::scoring::sasa::SasaCalc
set_use_big_polar_hydrogen(bool big_polar_h)	core::scoring::sasa::SasaCalc
setup_sasa_method(SasaRadii radii_set)	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
total_hsasa_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
total_hsasa_sc_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
total_rel_hsasa_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
total_sasa_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
total_sasa_sc_	core::scoring::sasa::SasaCalc	private
~SasaCalc() override	core::scoring::sasa::SasaCalc