Rosetta

apps → numeric Relation

File in src/appsIncludes file in src/numeric
pilot / amelie / detect_tight_clusters.ccrandom / random.hh
pilot / amelie / detect_tight_clusters.ccxyzVector.hh
pilot / amuenks / find_ligand_local_res.ccrandom / random.hh
pilot / amuenks / find_ligand_local_res.ccxyzMatrix.hh
pilot / amuenks / find_ligand_local_res.ccxyzVector.hh
pilot / amuenks / find_ligand_local_res.ccxyzVector.io.hh
public / analysis / HDXEnergy.ccNumericTraits.hh
pilot / aginsparg / holes_identifier.ccgeometry / hashing / xyzStripeHash.fwd.hh
pilot / aginsparg / holes_identifier.ccgeometry / hashing / xyzStripeHash.hh
pilot / aginsparg / holes_identifier.ccxyzVector.hh
pilot / aginsparg / ligand_discovery_search_protocol.ccgeometry / hashing / xyzStripeHash.fwd.hh
pilot / aginsparg / ligand_discovery_search_protocol.ccgeometry / hashing / xyzStripeHash.hh
pilot / aginsparg / ligand_discovery_search_protocol.ccxyzVector.hh
pilot / andrew / measure_catalytic_geometry.ccxyz.functions.hh
pilot / ameya / mixedMC.ccrandom / random.hh
pilot / andrew / mpi_msd.ccnumeric.functions.hh
public / analysis / per_residue_solvent_exposure.ccNumericTraits.hh
public / analysis / SID_ERMS_prediction.ccrandom / random.hh
public / analysis / SID_ERMS_prediction.ccrandom / uniform.hh
pilot / aginsparg / space_fill_analysis.ccgeometry / hashing / xyzStripeHash.fwd.hh
pilot / aginsparg / space_fill_analysis.ccgeometry / hashing / xyzStripeHash.hh
pilot / aginsparg / space_fill_analysis.ccxyzVector.hh
pilot / andrew / sweep_respair_energies.ccconstants.hh
pilot / andrew / sweep_respair_energies.ccrandom / random.hh
pilot / ralford / archive / check_rotation.ccxyz.functions.hh
pilot / ralford / archive / check_rotation.ccxyzVector.hh
pilot / ralford / archive / check_rotation.ccrandom / random.hh
pilot / ralford / archive / sample_tilt_protocol.ccxyzVector.hh
pilot / ralford / archive / transform_into_mem.ccrandom / random.hh
pilot / ralford / archive / translate_membrane_pose.ccrandom / random.hh
pilot / ralford / archive / translate_view_membrane.ccrandom / random.hh
pilot / awatkins / a3b_hbs_creator.ccrandom / random.hh
pilot / awatkins / a3b_test.ccrandom / random.hh
pilot / awatkins / aggregate_coarse_rna_vdw.ccMathNTensor.hh
pilot / awatkins / aggregate_coarse_rna_vdw.ccMathNTensor_io.hh
pilot / awatkins / cov_hbs.ccconversions.hh
pilot / awatkins / cov_hbs.ccxyz.functions.hh
pilot / awatkins / cov_hbs.ccrandom / random.hh
pilot / awatkins / cov_peptidomimetic_creator.ccconversions.hh
pilot / awatkins / cov_peptidomimetic_creator.ccxyz.functions.hh
pilot / awatkins / cov_peptidomimetic_creator.ccrandom / random.hh
pilot / awatkins / cov_test.ccconversions.hh
pilot / awatkins / get_dihedral_b3aa.ccangle.functions.hh
pilot / awatkins / macrocycle_sampling.ccrandom / random.hh
pilot / awatkins / macrocycle_sampling.ccxyzVector.hh
pilot / awatkins / make_a3b_bundle.ccrandom / random.hh
pilot / awatkins / make_a3b_bundle.ccrandom / uniform.hh
pilot / awatkins / make_a3b_bundle.ccconstants.hh
pilot / awatkins / make_ideal_a3b_fragment.ccrandom / random.hh
pilot / awatkins / mike_linker_test.ccrandom / random.hh
pilot / awatkins / mike_linker_test.ccNumericTraits.hh
pilot / awatkins / peptidomimetic_ensembles.ccrandom / random.hh
pilot / awatkins / peptidomimetic_ensembles.ccxyzVector.hh
pilot / awatkins / triazolamer_creator.ccrandom / random.hh
pilot / barak / barak.score.ccrandom / random.hh
pilot / barak / BuildFloppyTail.ccxyzVector.hh
pilot / barak / BuildFloppyTail.ccrandom / random.hh
pilot / barak / compare_rms_byres.ccconstants.hh
pilot / barak / compare_rms_byres.ccrandom / random.hh
pilot / barak / compare_structures.ccrandom / random.hh
pilot / barak / extend_range.ccrandom / random.hh
pilot / barak / overlay_bb_bondangles.ccrandom / random.hh
pilot / barak / overlay_sidechains.ccrandom / random.hh
pilot / barak / PeptideDeriver.ccxyzVector.hh
pilot / barak / PeptideDeriver.ccrandom / random.hh
pilot / barak / phosphorylate_position.ccrandom / random.hh
pilot / barak / print_phipsi.ccconstants.hh
pilot / barak / print_phipsi.ccrandom / random.hh
pilot / barak / test_frags.barak.ccrandom / random.hh
pilot / barak / thread_bb.ccrandom / random.hh
pilot / barak / thread_sidechains.ccrandom / random.hh
pilot / barthp / membrane_relax.ccxyzVector.hh
pilot / barthp / membrane_relax.ccrandom / random.hh
pilot / bazzoli / cnl_env_lost_hbs.ccxyzVector.hh
pilot / bazzoli / lig_polar_sat.ccxyzVector.hh
pilot / bazzoli / sel_hbonds.ccxyzVector.hh
pilot / bcorreia / iterative_design.ccxyzVector.hh
pilot / bder / HbondZinc.ccconversions.hh
pilot / bder / HbondZincBackbone.ccconversions.hh
pilot / bder / HbondZincHHHO.ccconversions.hh
pilot / bder / HbondZincHHHO.ccxyz.io.hh
pilot / bder / xtal_water_bunsat.ccxyzVector.hh
pilot / bder / ZincMinimize.ccxyzVector.hh
pilot / bder / ZincMinimize.ccxyz.io.hh
pilot / bder / ZincSiteEvaluator.ccxyzVector.hh
pilot / bder / ZincSiteEvaluator.ccconversions.hh
pilot / bder / ZincSiteEvaluator.ccxyz.functions.hh
public / scenarios / beta_strand_homodimer_design / homodimer_maker.ccxyzVector.io.hh
public / scenarios / beta_strand_homodimer_design / homodimer_maker.ccxyzVector.hh
pilot / biokhar / karen_compare_different_proteins.ccxyz.functions.hh
pilot / bjornw / jumpRT_test.ccxyzVector.io.hh
pilot / bjornw / jumpRT_test.ccxyzVector.hh
pilot / bjornw / jumpRT_test.ccxyz.functions.hh
pilot / blivens / disulfide_scorer.ccrandom / random.hh
pilot / brunette / armEval.ccconversions.hh
pilot / brunette / armEval.cctrig.functions.hh
pilot / brunette / armEval.ccxyz.functions.hh
pilot / brunette / armEval.ccxyzVector.hh
pilot / brunette / calc_ssm_energies_with_structure_profile.ccxyzVector.hh
pilot / brunette / calc_ssm_energies_with_structure_profile.ccxyz.functions.hh
pilot / brunette / evalFullLength.ccconversions.hh
pilot / brunette / evalFullLength.cctrig.functions.hh
pilot / brunette / evalFullLength.ccxyz.functions.hh
pilot / brunette / evalFullLength.ccxyzVector.hh
pilot / brunette / evalRepeats.ccconversions.hh
pilot / brunette / evalRepeats.cctrig.functions.hh
pilot / brunette / evalRepeats.ccxyz.functions.hh
pilot / brunette / evalRepeats.ccxyzVector.hh
pilot / brunette / extractNativeRepeats.ccconversions.hh
pilot / brunette / extractNativeRepeats.cctrig.functions.hh
pilot / brunette / extractNativeRepeats.ccxyz.functions.hh
pilot / brunette / extractNativeRepeats.ccxyzVector.hh
pilot / brunette / extractNativeRepeats.ccxyzMatrix.hh
pilot / brunette / extractNativeRepeats.ccrandom / random.hh
pilot / brunette / filterAlignments.ccxyzVector.hh
pilot / brunette / findNaturallyOccuringAlphaRepeats.ccconversions.hh
pilot / brunette / findNaturallyOccuringAlphaRepeats.cctrig.functions.hh
pilot / brunette / findNaturallyOccuringAlphaRepeats.ccxyz.functions.hh
pilot / brunette / findNaturallyOccuringAlphaRepeats.ccxyzVector.hh
pilot / brunette / repeat_dock.ccxyz.functions.hh
pilot / brunette / repeat_dock.ccxyzVector.hh
pilot / brunette / repeat_dock.ccxyzTransform.hh
pilot / brunette / unalignedEvaluate.ccxyzVector.hh
public / carbohydrates / dock_glycans.ccrandom / random.hh
public / scenarios / chemically_conjugated_docking / Gp_quantification_metrics.hhxyzVector.hh
public / scenarios / chemically_conjugated_docking / Gp_quantification_metrics.hhxyz.functions.hh
public / scenarios / chemically_conjugated_docking / Gp_quantification_metrics.hhconversions.hh
public / scenarios / chemically_conjugated_docking / UBQ_E2_thioester.ccconversions.hh
public / scenarios / chemically_conjugated_docking / UBQ_Gp_CYD-CYD.ccconversions.hh
pilot / chrisk / byres_data.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / byres_data.ccxyzMatrix.hh
pilot / chrisk / domain_assemble.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / domain_assemble.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / domain_assemble.ccxyzMatrix.hh
pilot / chrisk / hbscan.ccconstants.hh
pilot / chrisk / hbscan.ccconversions.hh
pilot / chrisk / pep_analysis.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pep_analysis.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pep_gly.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pep_gly.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pep_nrg.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pep_nrg.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pep_opt.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pep_opt.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pep_opt_parallel.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / chrisk / pep_opt_parallel.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pep_opt_parallel.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pep_paapp.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pep_paapp.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pep_prep.ccconversions.hh
pilot / chrisk / pep_prep.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pep_prep.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pep_prep.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / chrisk / pep_prep.ccNumericTraits.hh
pilot / chrisk / pep_prepspec.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pep_prepspec.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pep_rama.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pep_rama.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pep_ref.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pep_ref.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pep_spec.03-11.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pep_spec.03-11.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pep_spec.06-23.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pep_spec.06-23.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pep_spec.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pep_spec.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pep_spec_flx.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pep_spec_flx.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pep_spec_flx.mov.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pep_spec_flx.mov.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pepspec.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pepspec.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pepspec_anchor_dock.ccconversions.hh
pilot / chrisk / pepspec_anchor_dock.ccxyzVector.hh
pilot / chrisk / pepspec_anchor_dock.ccrandom / random.hh
pilot / chrisk / pepspec_anchor_dock.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / chrisk / pepspec_anchor_dock.ccNumericTraits.hh
pilot / christophe / PCS_main.ccrandom / random.hh
pilot / chu / zinc_stat.ccconversions.hh
pilot / chu / zinc_stat.ccxyzVector.hh
pilot / chu / zinc_stat.ccxyz.functions.hh
pilot / cmiles / kcluster.ccrandom / random.hh
pilot / colin / backrub_pilot.ccrandom / random.hh
pilot / colin / cterdesign.ccrandom / random.hh
pilot / colin / mm_params.ccxyz.functions.hh
pilot / colin / mm_params.ccconversions.hh
pilot / combss / generate_orbital_statistics.cchistograms / TwoDHistogram.hh
public / comparative_modeling / score_aln.ccmodel_quality / rms.hh
public / comparative_modeling / spheregrinder.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / csykang / make_retroinverso.ccxyzVector.hh
pilot / csykang / make_retroinverso.ccconversions.hh
pilot / dan / generate_matcher_constraints.ccxyz.functions.hh
pilot / dan / generate_matcher_constraints.ccconstants.hh
pilot / dan / loop_minimize.ccmodel_quality / rms.hh
public / darc / DARC.ccconstants.hh
public / darc / make_ray_files.ccrandom / random.hh
public / darc / make_ray_files.ccxyz.functions.hh
public / darc / make_ray_files.ccxyzMatrix.hh
public / ddg / cartesian_ddg.ccxyzVector.hh
public / ddg / cartesian_ddg.ccxyz.functions.hh
public / ddg / ensemble_generator_score12_sidechain_ver2.ccxyzVector.hh
public / ddg / minimize_with_cst.ccxyzVector.hh
pilot / dekim / decoy_features.ccnumeric.functions.hh
pilot / dekim / score_nonlocal_frags.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / delucasl / roc_optimizer.ccroc_curve.hh
pilot / delucasl / roc_test.ccroc_curve.hh
public / design / beta_peptide_modeling.ccxyz.functions.hh
public / design / beta_peptide_modeling.ccxyzVector.hh
public / design / beta_peptide_modeling.ccconversions.hh
public / design / zinc1_homodimer_design.ccxyz.io.hh
public / design / zinc1_homodimer_design.ccxyz.functions.hh
public / design / zinc1_homodimer_setup.ccxyzVector.hh
public / design / zinc1_homodimer_setup.ccxyzVector.io.hh
public / design / zinc2_homodimer_design.ccxyzVector.hh
public / design / zinc2_homodimer_setup.ccconversions.hh
public / design / zinc2_homodimer_setup.ccxyzVector.hh
public / design / zinc2_homodimer_setup.ccxyz.functions.hh
pilot / kale / detailed_balance / backbone_tests.ccrandom / random.hh
pilot / kale / detailed_balance / sidechain_tests.ccrandom / random.hh
pilot / dgront / hierarchical_clustering.ccClusteringTreeNode.hh
pilot / dgront / hierarchical_clustering.ccagglomerative_hierarchical_clustering.hh
pilot / dgront / JumpSpecificAbrelax.ccrandom / random.hh
pilot / dgront / LibraryJumpSetup.ccrandom / random.hh
pilot / dgront / SpecificJumpSetup.ccrandom / random.hh
pilot / doug / betacat_movie.ccrandom / random.hh
pilot / doug / get_dihedral_peptide.ccangle.functions.hh
pilot / doug / get_dihedral_peptoid.ccangle.functions.hh
pilot / doug / noah_score_interface.ccxyzVector.hh
pilot / doug / peptoid_rotamer_prediction_benchmark.ccangle.functions.hh
pilot / doug / rotamer_prediction_benchmark.ccangle.functions.hh
public / DRRAFTER / fit_helix_in_map.ccrandom / random.hh
pilot / dwkulp / flexibleLoopDesign.ccrandom / random.hh
pilot / dwkulp / reportFragments.ccrandom / random.hh
public / electron_density / denovo_density.ccxyzVector.hh
public / electron_density / denovo_density.ccxyzVector.io.hh
public / electron_density / denovo_density.ccrandom / random.hh
public / electron_density / density_tools.ccxyzVector.hh
public / electron_density / density_tools.ccrandom / random.hh
public / electron_density / density_tools.ccconstants.hh
public / electron_density / dgdp.ccxyzMatrix.hh
public / electron_density / dgdp.ccxyzVector.hh
public / electron_density / dgdp.ccxyzVector.io.hh
public / electron_density / sim_cryo.ccrandom / random.hh
public / electron_density / sim_cryo.ccUniformRotationSampler.hh
public / electron_density / sim_cryo.ccxyzMatrix.hh
public / electron_density / sim_cryo.ccxyzVector.hh
public / electron_density / sim_cryo.ccxyzVector.io.hh
public / rna / erraser / erraser2.ccrandom / random.hh
public / rna / erraser / erraser2.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / eva / adapt_rotamers.ccxyzVector.hh
pilot / eva / adapt_rotamers.ccrandom / random.hh
pilot / kale / examples / atom_id_demo.ccxyzVector.hh
pilot / kale / examples / atom_id_demo.ccconstants.hh
pilot / kale / examples / atom_id_demo.ccnumeric.functions.hh
pilot / kale / examples / boost_matrix.cctypes.hh
pilot / kale / examples / broken_original_kick.ccrandom / random.hh
pilot / kale / examples / broken_original_kick.cckinematic_closure / types.hh
pilot / kale / examples / dihedral.ccxyz.functions.hh
pilot / kale / examples / dihedral.ccxyzVector.hh
pilot / kale / examples / kic_bug.ccrandom / random.hh
pilot / kale / examples / kic_rama_bias.ccrandom / random.hh
pilot / kale / examples / kic_rama_bias.ccconversions.hh
pilot / kale / examples / kick_n_terminus.ccxyzVector.hh
pilot / kale / examples / kick_n_terminus.ccxyzVector.io.hh
pilot / kale / examples / kick_n_terminus.ccrandom / random.hh
pilot / kale / examples / random_seed.ccrandom / random.hh
pilot / kale / examples / vector_math.ccxyzVector.hh
pilot / kale / examples / vector_math.ccMathVector.hh
pilot / kale / examples / vector_math.ccMathVector_operations.hh
pilot / kale / examples / xyz_from_pose.ccxyzVector.hh
pilot / dgront / experiments / AllCrmsd.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / dgront / experiments / call_mover.ccrandom / random.hh
pilot / dgront / experiments / DisulfideBondEnergy.ccxyz.functions.hh
pilot / dgront / experiments / DisulfideBondEnergy.ccxyzMatrix.hh
pilot / fcchou / adenosine_stack_test.ccxyzVector.hh
pilot / fcchou / adenosine_stack_test.ccconversions.hh
pilot / fcchou / lariat_modeling.ccrandom / random.hh
pilot / fcchou / lariat_modeling.ccxyzVector.hh
pilot / fcchou / lariat_modeling.ccxyzMatrix.hh
pilot / fcchou / lariat_modeling.ccconversions.hh
pilot / fcchou / swa_rna_analytical_closure.ccxyzVector.hh
pilot / fcchou / swa_rna_analytical_closure.ccconversions.hh
pilot / fcchou / turner_test_double_helix.ccrandom / random.hh
pilot / fcchou / turner_test_double_helix.ccxyzVector.hh
pilot / fcchou / turner_test_double_helix.ccxyzMatrix.hh
pilot / fcchou / turner_test_double_helix.ccconversions.hh
pilot / fcchou / turner_test_double_helix.ccxyz.functions.hh
pilot / fcchou / turner_test_double_helix.ccangle.functions.hh
pilot / fcchou / turner_test_one_chain.ccrandom / random.hh
pilot / fcchou / turner_test_one_chain.ccxyzVector.hh
pilot / fcchou / turner_test_one_chain.ccxyzMatrix.hh
pilot / fcchou / turner_test_one_chain.ccconversions.hh
pilot / fcchou / turner_test_one_chain.ccxyz.functions.hh
pilot / fcchou / turner_test_one_chain.ccangle.functions.hh
pilot / fcchou / turner_two_chain.ccrandom / random.hh
pilot / fcchou / turner_two_chain.ccxyzVector.hh
pilot / fcchou / turner_two_chain.ccxyzMatrix.hh
pilot / fcchou / turner_two_chain.ccconversions.hh
pilot / fcchou / turner_two_chain.ccxyz.functions.hh
pilot / fcchou / turner_two_chain.ccangle.functions.hh
public / fiber_diffraction / FiberDiffractionFreeSet.ccrandom / random.hh
pilot / fordas / lsmgridprobe.ccxyzVector.hh
pilot / fordas / lsmgridprobe.ccxyzMatrix.hh
pilot / fordas / lsmgridprobe.ccsphericalVector.hh
pilot / fordas / lsmgridprobe.ccxyz.functions.hh
pilot / ralford / archive / framework_devel / local_minimize.ccrandom / random.hh
pilot / ralford / archive / framework_devel / visualize_membrane.ccxyz.functions.hh
pilot / ralford / archive / framework_devel / visualize_membrane.ccxyzVector.hh
pilot / ralford / archive / framework_devel / visualize_membrane.ccrandom / random.hh
pilot / frank / calc_ssm_energies.ccxyzVector.hh
pilot / frank / calc_ssm_energies.ccxyz.functions.hh
pilot / frank / cart_refine.ccxyzVector.hh
pilot / frank / cart_refine.ccrandom / random.hh
pilot / frank / cryst_design.ccrandom / random.hh
pilot / frank / cryst_design.ccfourier / FFT.hh
pilot / frank / cryst_design.ccxyzMatrix.hh
pilot / frank / cryst_design.ccxyzVector.hh
pilot / frank / cryst_design.ccxyz.functions.hh
pilot / frank / cryst_design.ccUniformRotationSampler.hh
pilot / frank / cryst_design.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / frank / cryst_gen.ccconstants.hh
pilot / frank / cryst_gen.ccxyzMatrix.hh
pilot / frank / cryst_gen.ccxyzVector.hh
pilot / frank / cryst_gen.ccxyz.functions.hh
pilot / frank / cryst_reporters.hhxyzMatrix.hh
pilot / frank / cryst_reporters.hhxyzVector.hh
pilot / frank / cryst_reporters.hhrandom / random.hh
pilot / frank / fasol_perres.ccxyzVector.hh
pilot / frank / make_rms_filtered_fragfile.ccxyz.functions.hh
pilot / frank / map_morph.ccxyz.functions.hh
pilot / frank / map_morph.ccxyzVector.hh
pilot / frank / map_morph.ccrandom / random.hh
pilot / frank / map_morph.ccconstants.hh
pilot / frank / pdb_gen_cryst.ccxyzMatrix.hh
pilot / frank / pdb_gen_cryst.ccxyzVector.hh
pilot / frank / perturb_structure.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / frank / perturb_structure.ccrandom / random.hh
pilot / frank / pseudo_ca_trace.ccxyzVector.hh
pilot / frank / pseudo_ca_trace.ccxyz.functions.hh
pilot / frank / spacegroup.hhxyzMatrix.hh
pilot / frank / spacegroup.hhxyzVector.hh
pilot / frank / spacegroup.hhxyz.functions.hh
pilot / frankdt / concatenate_poses.ccrandom / random.hh
pilot / frankdt / concatenate_poses.ccHomogeneousTransform.hh
pilot / frankdt / steric_fusion_scan.ccrandom / random.hh
pilot / frankdt / steric_fusion_scan.ccHomogeneousTransform.hh
pilot / gktaylor / create_constraints.ccxyzVector.hh
pilot / gktaylor / create_constraints.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_cbdock.ccconversions.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_cbdock.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_cbdock.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_cbdock.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_cbdock.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_linker.ccconversions.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_linker.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_linker.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_linker.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_linker.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_mat_vec.hhIOTraits.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_refold.hhxyz.io.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_score.ccconversions.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_score.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_score.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_score.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_score.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_test.ccconversions.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_test.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_test.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_test.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_test.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_test_Mxform.ccconversions.hh
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pilot / will / old / gpu / gpu_test_Mxform.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_test_Mxform.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / gpu / gpu_test_Mxform.ccxyz.io.hh
pilot / grant / AbInitio_MPI.ccrandom / random.hh
pilot / guangfeng / align_substructure.ccxyzMatrix.hh
pilot / guangfeng / align_substructure.ccxyzVector.hh
pilot / guangfeng / align_substructure.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / guffysl / heme_binding.ccconversions.hh
pilot / guffysl / heme_binding.ccrandom / random.hh
pilot / habib / david_align_and_recompute_score_and_rmsd.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / habib / david_align_append_and_recompute_score_and_rmsd.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / habib / david_darc_multirun.ccconversions.hh
pilot / habib / david_darc_multirun.ccxyz.functions.hh
pilot / habib / david_darc_multirun.ccxyzMatrix.hh
pilot / habib / david_darc_multirun.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / habib / david_darc_multirun.ccmodel_quality / maxsub.hh
pilot / habib / david_find_best_contact_pocket.ccxyz.functions.hh
pilot / habib / david_find_best_contact_pocket.ccxyzMatrix.hh
pilot / habib / david_find_best_contact_pocket.ccrandom / random.hh
pilot / habib / david_find_best_pocket.ccrandom / random.hh
pilot / habib / david_find_best_pocket.ccxyz.functions.hh
pilot / habib / david_find_best_pocket.ccxyzMatrix.hh
pilot / habib / david_find_surface_residues.ccrandom / random.hh
pilot / habib / david_rotation_experiment.ccxyz.functions.hh
pilot / habib / david_rotation_experiment.ccxyzMatrix.hh
pilot / habib / david_rotation_experiment.ccrandom / random.fwd.hh
pilot / smlewis / hect / HECT.hhxyz.functions.hh
pilot / hpark / min_test.ccxyzVector.hh
pilot / hpark / min_test.ccrandom / random.hh
pilot / hpark / min_test_hpark.ccxyzVector.hh
pilot / hpark / min_test_hpark.ccrandom / random.hh
pilot / hpark / NMsearch.ccrandom / random.hh
pilot / hpark / sampling_movers.ccrandom / random.hh
pilot / hpark / sampling_movers.hhrandom / random.hh
pilot / hpark / test_bbmc.ccrandom / random.hh
pilot / hpark / test_bbmc.ccMultiDimensionalHistogram.hh
pilot / hpark / test_bbmc.org.ccrandom / random.hh
pilot / hpark / test_bbmc.org.ccMultiDimensionalHistogram.hh
pilot / hpark / test_LH.ccrandom / random.hh
pilot / hpark / test_sampling.ccrandom / random.hh
pilot / ian / ligand_evis.ccrandom / random.hh
pilot / ian / ligand_evis.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / ian / redo_rms_atomtree_diffs.ccconversions.hh
pilot / ian / redo_rms_atomtree_diffs.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / ian / redo_rms_atomtree_diffs.ccxyzVector.io.hh
pilot / kale / kic_refactor / ideas / original_app.ccrandom / random.hh
pilot / jackmaguire / benchmark_k_medoids.ccrandom / random.hh
pilot / jacob / cxdesign.ccconversions.hh
pilot / jacob / cxdesign.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / jacob / cxdesign.ccrandom / random.hh
pilot / jacob / cxdesign.ccxyz.functions.hh
pilot / jacob / cxdesign.ccxyz.io.hh
pilot / jacob / cxdock.ccconversions.hh
pilot / jacob / cxdock.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / jacob / cxdock.ccrandom / random.hh
pilot / jacob / cxdock.ccxyz.functions.hh
pilot / jacob / cxdock.ccxyz.io.hh
pilot / jadolfbr / AntibodyInfoRMLoader.ccxyzVector.hh
pilot / jadolfbr / model_antibody_basic.ccxyzVector.hh
pilot / jadolfbr / model_antibody_basic.ccrandom / random.hh
pilot / jadolfbr / model_antibody_basic.ccconstants.hh
pilot / james / add_ligand.ccrandom / random.hh
pilot / james / add_ligand.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / james / angles.ccxyzVector.hh
pilot / james / anneal_align.ccrandom / random.hh
pilot / james / burial.ccxyzVector.hh
pilot / james / burial.ccrandom / random.hh
pilot / james / ca_build.ccrandom / random.hh
pilot / james / casp9_superdev.ccxyzVector.hh
pilot / james / constraints_matrix.ccxyzVector.hh
pilot / james / constraints_matrix.ccrandom / random.hh
pilot / james / constraints_viewer.ccxyzVector.hh
pilot / james / constraints_viewer.ccrandom / random.hh
pilot / james / cs_align.ccrandom / random.hh
pilot / james / cst_func.ccxyzVector.hh
pilot / james / cst_func.ccrandom / random.hh
pilot / james / density_grid.cckdtree / util.hh
pilot / james / density_grid.cckdtree / KDTree.hh
pilot / james / density_grid.cckdtree / KDPoint.hh
pilot / james / density_grid.cckdtree / KDPointList.hh
pilot / james / density_grid.cckdtree / WrappedReal.hh
pilot / james / dp_align.ccrandom / random.hh
pilot / james / filter_sequences.ccrandom / random.hh
pilot / james / hybrid.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / james / jcluster.ccrandom / random.fwd.hh
pilot / james / jdock.ccxyzVector.hh
pilot / james / jseq.ccxyzVector.hh
pilot / james / kdtree_disulf.ccrandom / random.hh
pilot / james / kdtree_disulf.ccxyzMatrix.hh
pilot / james / kdtree_disulf.ccxyzMatrix.fwd.hh
pilot / james / kdtree_disulf.ccxyz.functions.hh
pilot / james / kdtree_disulf.cckdtree / util.hh
pilot / james / kdtree_disulf.cckdtree / calc_distance.hh
pilot / james / kdtree_disulf.cckdtree / nearest_neighbors.hh
pilot / james / kdtree_disulf.cckdtree / KDTree.hh
pilot / james / kdtree_disulf.cckdtree / KDPoint.hh
pilot / james / kdtree_disulf.cckdtree / KDPointList.hh
pilot / james / kdtree_disulf.cckdtree / WrappedPrimitive.hh
pilot / james / make_profile.ccrandom / random.hh
pilot / james / mammoth_hack.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / james / mammoth_hack.ccnumeric.functions.hh
pilot / james / mammoth_hack.cctrig.functions.hh
pilot / james / mammoth_hack.cctypes.hh
pilot / james / mammoth_hack.ccxyz.functions.fwd.hh
pilot / james / mammoth_hack.ccxyzMatrix.fwd.hh
pilot / james / mammoth_hack.ccxyzVector.fwd.hh
pilot / james / mammoth_hack.ccxyzVector.hh
pilot / james / mammoth_hack.ccmodel_quality / RmsData.hh
pilot / james / mammoth_hack.ccrandom / random.fwd.hh
pilot / james / mammoth_hack.ccrandom / random.hh
pilot / james / mammoth_hack.ccrandom / uniform.hh
pilot / james / model_quality.ccxyzVector.hh
pilot / james / model_quality.ccnumeric.functions.hh
pilot / james / model_quality.cctrig.functions.hh
pilot / james / model_quality.ccxyz.functions.fwd.hh
pilot / james / model_quality.ccxyzMatrix.fwd.hh
pilot / james / model_quality.ccxyzVector.fwd.hh
pilot / james / model_quality.ccrandom / random.fwd.hh
pilot / james / model_quality.ccrandom / random.hh
pilot / james / model_quality.ccrandom / uniform.hh
pilot / james / phi_hack.ccrandom / random.hh
pilot / james / phi_hack.ccrandom / random.fwd.hh
pilot / james / pick_frags.ccrandom / random.hh
pilot / james / prof_search.ccrandom / random.hh
pilot / james / seqdb_stats.ccrandom / random.hh
pilot / james / silent_cst_quality.ccxyzVector.hh
pilot / james / simple_cm.ccrandom / random.hh
pilot / james / sparta_superdev.ccxyzVector.hh
pilot / james / super.ccxyzVector.hh
pilot / james / thread_fast.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / javierbq / detect_symmetry.ccxyzMatrix.hh
pilot / javierbq / detect_symmetry.ccxyzVector.hh
pilot / javierbq / detect_symmetry.ccxyz.functions.hh
pilot / javierbq / fragment_sequence_quality.ccangle.functions.hh
pilot / javierbq / fragment_sequence_quality.ccconversions.hh
pilot / javierbq / fragment_sequence_quality.ccxyz.functions.hh
pilot / javierbq / swap_elements.ccxyz.functions.hh
pilot / javierbq / swap_elements.ccxyzVector.hh
pilot / javierbq / swap_elements.ccxyzMatrix.hh
pilot / jcorn / TwoChainInterface.ccrandom / random.hh
pilot / jcorn / TwoChainTenANeighbors.ccrandom / random.hh
pilot / jim / optE_test.ccxyzVector.hh
pilot / jim / optE_test.ccrandom / random.hh
pilot / jim / use_asn_motifs.ccxyzVector.hh
pilot / jim / use_asn_motifs.ccrandom / random.hh
pilot / jkleman / input_from_cmd.ccxyzVector.hh
pilot / jkleman / mp_find_interface_test.ccrandom / random.hh
pilot / jkleman / mp_find_interface_test.ccxyzVector.hh
pilot / jkleman / mp_find_interface_test.ccxyzMatrix.hh
pilot / jkleman / mp_find_interface_test.ccxyz.functions.hh
pilot / jkleman / mp_find_interface_test.ccconversions.hh
pilot / jkleman / mp_parameters.ccxyzVector.hh
pilot / jkleman / mpframework_test.ccxyzVector.hh
pilot / jkleman / mpframework_test1.ccrandom / random.hh
pilot / jkleman / mpframework_test1.ccxyzVector.hh
pilot / jkleman / mpframework_test1.ccxyzMatrix.hh
pilot / jkleman / mpframework_test1.ccxyz.functions.hh
pilot / jkleman / mpframework_test1.ccconversions.hh
pilot / jkleman / mpframework_test2.ccxyzVector.hh
pilot / jkleman / mpframework_test2.ccxyz.functions.hh
pilot / jkleman / mpframework_test2.ccconversions.hh
pilot / jkleman / mpframework_test2.ccnumeric.functions.hh
pilot / jkleman / mpframework_test2.ccutil.hh
pilot / johnk / johnk_interface_geosol_minimization.ccconstants.hh
pilot / johnk / johnk_parametrize_geometric_solvation.ccconstants.hh
pilot / johnk / johnk_parametrize_geometric_solvation.ccconversions.hh
pilot / johnk / old_test_geosol_minimization.ccconstants.hh
pilot / johnk / phosphoArg_build_rotamers.ccxyzVector.hh
pilot / johnk / phosphoArg_minimize.ccxyzVector.hh
pilot / johnk / srirupa_phosphoArg_build_rotamers.ccxyzVector.hh
pilot / kdrew / ld_converter.ccconversions.hh
pilot / kenjung / sixdtreeTEST.ccgeometry / hashing / SixDHasher.hh
pilot / kenjung / symfragrm.ccgeometry / hashing / SixDHasher.hh
pilot / kevin / BuriedUnsatPolarsFinder2.ccxyzVector.hh
pilot / kevin / BuriedUnsatPolarsFinder2.ccconversions.hh
pilot / kevin / BuriedUnsatPolarsFinder3.ccxyzVector.hh
pilot / kevin / BuriedUnsatPolarsFinder3.ccconversions.hh
pilot / kevin / hydrate.ccxyz.functions.hh
pilot / kevin / hydrate.ccxyzVector.hh
pilot / kevin / hydrate.ccxyzMatrix.hh
pilot / kevin / hydrate.ccHomogeneousTransform.hh
pilot / kevin / khSandbox.ccxyzVector.hh
pilot / kevin / khSandbox.ccconversions.hh
pilot / kevin / khSandbox2.ccxyzVector.hh
pilot / kevin / khXtal_water_bunsat.ccxyzVector.hh
pilot / kevin / template.ccxyzVector.hh
pilot / kevin / template.ccconversions.hh
pilot / kevin / wat_distances.ccxyzVector.hh
pilot / kale / kic_refactor / KicSandbox.hhrandom / random.hh
pilot / kkappel / calculate_distances.ccxyzMatrix.hh
pilot / kkappel / move_jump.ccrandom / random.hh
pilot / kkappel / test_rna_protein.ccrandom / random.hh
pilot / kyleb / fragment_extract.ccxyzVector.hh
pilot / kyleb / fragment_extract.ccconversions.hh
pilot / kyleb / fragment_extract.ccrandom / random.hh
pilot / kyleb / fragment_extract.ccxyz.functions.hh
pilot / kyleb / fragment_extract.ccangle.functions.hh
pilot / rhiju / legacy / add_delete_monte_carlo.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / legacy / add_delete_monte_carlo.ccconversions.hh
pilot / rhiju / legacy / add_delete_monte_carlo.ccrandom / random.hh
pilot / rhiju / legacy / erraser_monte_carlo.ccrandom / random.hh
pilot / rhiju / legacy / OLD_TRIAL_protein_helix_assemble.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / legacy / OLD_TRIAL_protein_helix_assemble.ccconversions.hh
pilot / rhiju / legacy / stepwise_test.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / legacy / stepwise_test.ccconversions.hh
pilot / rhiju / legacy / stepwise_test.ccrandom / random.hh
pilot / rhiju / legacy / stepwise_test.ccxyz.functions.hh
pilot / rhiju / legacy / stepwise_test.ccangle.functions.hh
pilot / rhiju / legacy / TRIAL_protein_helix_assemble.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / legacy / TRIAL_protein_helix_assemble.ccconversions.hh
pilot / rhiju / legacy / TRIAL_protein_helix_assemble.ccrandom / random.hh
pilot / rhiju / legacy / TRIAL_protein_helix_assemble.ccxyz.functions.hh
pilot / rhiju / legacy / TRIAL_protein_helix_assemble.ccangle.functions.hh
pilot / rhiju / legacy / turner_rules_test.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / legacy / turner_rules_test.ccxyzMatrix.hh
pilot / rhiju / legacy / turner_rules_test.ccconversions.hh
pilot / rhiju / legacy / turner_rules_test.ccxyz.functions.hh
pilot / rhiju / legacy / turner_rules_test.ccangle.functions.hh
pilot / rhiju / legacy / turner_rules_test_WORKS.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / legacy / turner_rules_test_WORKS.ccxyzMatrix.hh
pilot / rhiju / legacy / turner_rules_test_WORKS.ccconversions.hh
pilot / rhiju / legacy / turner_rules_test_WORKS.ccxyz.functions.hh
pilot / rhiju / legacy / turner_rules_test_WORKS.ccangle.functions.hh
public / stepwise / legacy / swa_rna_util.ccxyzVector.hh
public / stepwise / legacy / swa_rna_util.ccxyz.functions.hh
pilot / lemmon / deepMove.ccxyzVector.hh
public / sewing / ligand_sewing_tools / generate_starting_zinc_sites.ccrandom / random.hh
public / sewing / ligand_sewing_tools / generate_starting_zinc_sites.ccconstants.hh
public / sewing / ligand_sewing_tools / zinc_statistic_generator.ccxyzVector.hh
pilot / lior / CycDsulf.ccconstants.hh
pilot / lior / CycDsulf.ccrandom / random.hh
pilot / lior / CycPepMain.ccrandom / random.hh
pilot / lior / CycPepMain.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / liz / close_homolog_refinement.ccxyzVector.hh
pilot / liz / close_homolog_refinement.ccrandom / random.hh
pilot / liz / consolidate_clusters.ccutil.hh
pilot / liz / ensemble_generator.ccxyzVector.hh
pilot / liz / ensemble_generator.ccrandom / random.hh
pilot / liz / ensemble_generator_score12_sidechain.ccxyzVector.hh
pilot / liz / ensemble_generator_score12_sidechain.ccrandom / random.hh
pilot / liz / minimize_with_cst.ccxyzVector.hh
pilot / liz / minimize_with_cst.ccrandom / random.hh
pilot / liz / monomer_ddg.ccxyzVector.hh
pilot / liz / monomer_ddg.ccrandom / random.hh
pilot / liz / sasa.ccxyzVector.hh
pilot / liz / sasa.ccrandom / random.hh
pilot / liz / score_ddgs.ccrandom / random.hh
public / loop_modeling / loodo.ccgeometry / hashing / SixDHasher.fwd.hh
public / loop_modeling / loodo.ccHomogeneousTransform.hh
public / loop_modeling / loodo.ccxyzVector.hh
public / loop_modeling / transform_loodo.ccxyzVector.hh
public / loop_modeling / transform_loodo.ccxyzMatrix.hh
pilot / maprahamian / burial_measure_sphere.ccNumericTraits.hh
pilot / maprahamian / per_residue_solvent_exposure.ccNumericTraits.hh
pilot / mdsmith / ligand_motifs.ccxyzVector.hh
pilot / mdsmith / ligand_motifs.ccrandom / random.hh
public / membrane / mp_domain_assembly.ccrandom / random.hh
pilot / mike / alignanalyse.ccxyzVector.hh
pilot / mike / alignanalyse.ccrandom / random.hh
pilot / mike / energy_diff.ccrandom / random.hh
pilot / mike / evolution.ccrandom / random.hh
pilot / mike / loophash.ccrandom / random.hh
pilot / mike / loophash.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / mike / loophash_analyse.ccHomogeneousTransform.hh
pilot / mike / loophash_analyse.ccgeometry / hashing / SixDHasher.hh
pilot / mike / loophash_cenrelax.ccHomogeneousTransform.hh
pilot / mike / loophash_cenrelax.ccgeometry / hashing / SixDHasher.hh
pilot / mike / loophash_test.ccrandom / random.hh
pilot / mike / md.ccxyzVector.hh
pilot / mike / md.ccrandom / random.hh
pilot / mike / mikejd2test.ccrandom / random.hh
pilot / mike / minbench.ccrandom / random.hh
pilot / mike / relax_viewer.ccxyzVector.hh
pilot / mike / relax_viewer.ccrandom / random.hh
pilot / mike / sctrials.ccrandom / random.hh
pilot / mike / silent2cst.ccxyzVector.hh
pilot / mike / testderiv.ccxyzVector.hh
pilot / mike / testderiv.ccrandom / random.hh
pilot / momeara / hbond_param_sweep.ccxyz.functions.hh
pilot / monica / dock_test.ccrandom / random.hh
pilot / monica / monica_relax.ccrandom / random.hh
pilot / monica / moves_test.ccrandom / random.hh
public / motif_dock / make_motif_tables.ccgeometry / hashing / SixDHasher.fwd.hh
public / motif_ligand_discovery / ligand_discovery_search_protocol.ccgeometry / hashing / xyzStripeHash.hh
public / motif_ligand_discovery / ligand_discovery_search_protocol.ccgeometry / hashing / xyzStripeHash.fwd.hh
public / motif_ligand_discovery / ligand_discovery_search_protocol.ccxyzVector.hh
pilot / mseetin / convert_pdb_to_silent_file.ccxyzVector.hh
pilot / mseetin / convert_pdb_to_silent_file.ccxyzMatrix.hh
pilot / mseetin / convert_pdb_to_silent_file.ccconversions.hh
pilot / nannemdp / params2pdb.ccxyz.functions.hh
pilot / kale / native_ensemble / native_ensemble.ccrandom / random.hh
pilot / neil / calc_ddG.ccrandom / random.hh
pilot / neil / char_native.ccrandom / random.hh
pilot / neil / coiled_coil_search.ccrandom / random.hh
pilot / neil / coiled_coil_search.ccxyz.functions.hh
pilot / neil / coiled_coil_search.ccxyz.io.hh
pilot / neil / des_pos_ddG.ccrandom / random.hh
pilot / neil / design_symm.bak.110314.ccrandom / random.hh
pilot / neil / design_symm.ccrandom / random.hh
pilot / neil / design_symm_110330_good.ccrandom / random.hh
pilot / neil / design_symm_no_hack_elec.ccrandom / random.hh
pilot / neil / enumeration_test.ccrandom / random.hh
pilot / neil / matdes_design.ccrandom / random.hh
pilot / neil / matdes_design_2comp.ccrandom / random.hh
pilot / neil / matdes_dock.ccrandom / random.hh
pilot / neil / matdes_mutalyze.ccrandom / random.hh
pilot / neil / relax_building_block.ccrandom / random.hh
pilot / neil / symdock_enum.ccconstants.hh
pilot / neil / symdock_enum.ccxyz.functions.hh
pilot / neil / symdock_enum.ccxyz.io.hh
pilot / neil / symdock_enum_3_1.ccconstants.hh
pilot / neil / symdock_enum_3_1.ccxyz.functions.hh
pilot / neil / symdock_enum_3_1.ccxyz.io.hh
pilot / nir / PeptideDeriver.ccxyzVector.hh
pilot / nir / PeptideDeriver.ccrandom / random.hh
public / nmr / ligand_transform_with_pcs.ccrandom / random.hh
public / nmr / ligand_transform_with_pcs.ccxyz.functions.hh
pilot / nobuyasu / pair_distance.ccxyzVector.hh
pilot / will / old / atom_design.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / atom_design.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / atom_design.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / bpy.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / will / old / bpy.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / bpy.ccxyz.functions.hh
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pilot / will / old / coiled_coil.ccmodel_quality / rms.hh
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pilot / will / old / coiled_coil.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / coiled_coil_zn.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / will / old / coiled_coil_zn.ccrandom / random.hh
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pilot / will / old / crossmatch.ccmodel_quality / rms.hh
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pilot / will / old / CXdock.ccconversions.hh
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pilot / will / old / CXdock_TMP.ccconversions.hh
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pilot / will / old / cycgly_bbg8t3a.ccrandom / random.hh
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pilot / will / old / d3_bpy_linker.ccconversions.hh
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pilot / will / old / design_DL.ccconversions.hh
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pilot / will / old / gen3bpy.ccconversions.hh
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pilot / will / old / gen_d2.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / gen_d2.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / gen_d2.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / gen_d2.cckinematic_closure / bridgeObjects.hh
pilot / will / old / gen_d2_3his_ooc.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / will / old / gen_d2_3his_ooc.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / gen_d2_3his_ooc.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / gen_d2_3his_ooc.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / gen_d2_3his_ooc.cckinematic_closure / bridgeObjects.hh
pilot / will / old / gen_d2_3his_ooc.cckinematic_closure / kinematic_closure_helpers.hh
pilot / will / old / gen_d2_4his.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / gen_d2_4his.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / gen_d2_4his.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / gen_d2_4his.cckinematic_closure / bridgeObjects.hh
pilot / will / old / gen_d2_hhhc.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / gen_d2_hhhc.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / gen_d2_hhhc.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / gen_d2_hhhc.cckinematic_closure / bridgeObjects.hh
pilot / will / old / gen_disulf_homodimer.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / gen_disulf_homodimer.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / gen_disulf_homodimer.ccxyz.io.hh
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pilot / will / old / gen_homo_hc.ccrandom / random.hh
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pilot / will / old / gen_homo_hc.ccxyz.io.hh
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pilot / will / old / gen_trimer_disulf.ccconversions.hh
pilot / will / old / gen_trimer_disulf.ccrandom / random.hh
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pilot / will / old / gen_xtal_dimer_from_trimer.ccconversions.hh
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pilot / will / old / gen_xtal_dimer_from_trimer.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / gen_xtal_dimer_from_trimer.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / genI213.ccconversions.hh
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pilot / will / old / genI213_2dsf.ccconversions.hh
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pilot / will / old / genI213_nocontacts.ccconversions.hh
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pilot / will / old / gensym_3bpy_from_dimer.ccconversions.hh
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pilot / will / old / gentetra.ccconversions.hh
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pilot / will / old / gentetra_from_trimer.ccconversions.hh
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pilot / will / old / getDistConstraints.ccmodel_quality / rms.hh
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pilot / will / old / hczndimer.ccconversions.hh
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pilot / will / old / helix_assembly.ccconversions.hh
pilot / will / old / helix_assembly.ccmodel_quality / rms.hh
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pilot / will / old / helix_assembly.ccxyzTransform.hh
pilot / will / old / helix_assembly.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / helix_assembly.ccxyzVector.hh
pilot / will / old / heterodock.ccconversions.hh
pilot / will / old / heterodock.ccmodel_quality / rms.hh
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pilot / will / old / heterodock.ccxyzTransform.hh
pilot / will / old / holes2_training_data.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / will / old / holes2_training_data.ccmodel_quality / RmsData.hh
pilot / will / old / holes_pbpdb.ccmodel_quality / rms.hh
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pilot / will / old / hubabinitio.ccmodel_quality / rms.hh
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pilot / will / old / hubabinitio.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / hubabinitio.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / hubdenovo.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / will / old / hubdenovo.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / hubdenovo.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / hubdenovo.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / hubfragdesign.ccmodel_quality / rms.hh
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pilot / will / old / hubfragdesign.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / hubfragdesign.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / IKFGDB.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / IKFGDB.ccconstants.hh
pilot / will / old / IKFGDB.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / IKFGDB.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / isct_test.ccconstants.hh
pilot / will / old / isct_test.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / isct_test.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / match_disulf.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / will / old / match_disulf.ccxyzVector.hh
pilot / will / old / match_disulf.ccxyzVector.io.hh
pilot / will / old / minimize.ccxyzVector.hh
pilot / will / old / minimize.ccxyzMatrix.hh
pilot / will / old / minimize.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / minimize_cavities.ccxyzVector.hh
pilot / will / old / minimize_cavities.ccio.hh
pilot / will / old / mkresfile_i213.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / motif_denovo_hb.ccconversions.hh
pilot / will / old / motif_denovo_hb.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / will / old / motif_denovo_hb.ccrandom / random.hh
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pilot / will / old / SphereSample.hhxyzVector.hh
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pilot / will / old / symdock_hybrid_cc3.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / symdock_hybrid_cc3.ccxyz.functions.hh
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pilot / will / old / tcdock.ccconstants.hh
pilot / will / old / tcdock.ccxyz.functions.hh
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pilot / will / old / test_ikrs.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / test_ikrs.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / test_ikrs.cckinematic_closure / bridgeObjects.hh
pilot / will / old / test_ikrs.ccNumericTraits.hh
pilot / will / old / test_ikrs2.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / test_ikrs2.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / test_ikrs2.cckinematic_closure / bridgeObjects.hh
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pilot / will / old / test_ikrs2.ccNumericTraits.hh
pilot / will / old / test_ikrs_flymake.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / test_ikrs_flymake.ccxyz.io.hh
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pilot / will / old / test_kc.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / test_kc.cckinematic_closure / bridgeObjects.hh
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pilot / will / old / test_kc.ccconversions.hh
pilot / will / old / test_leerichards.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / test_leerichards.ccxyz.functions.hh
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pilot / will / old / test_loop_hash.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / test_loop_hash.ccxyz.io.hh
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pilot / will / old / test_rose.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / test_rose.ccxyzTransform.hh
pilot / will / old / ward_design.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / will / old / ward_design.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / ward_design.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / ward_design.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / will_mutalyze.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / willmatch_2d6_bhe.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / willmatch_2d6_bhe.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / willmatch_chorismate.ccxyz.functions.hh
pilot / will / old / willmatch_chorismate.ccxyz.io.hh
pilot / will / old / willmatch_d6_bpy.ccxyz.functions.hh
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pilot / will / old / xyzStripeHash_dump.ccgeometry / hashing / xyzStripeHashWithMeta.hh
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pilot / will / old / xyzStripeHash_test.ccxyzVector.hh
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pilot / will / old / yeates_align.ccrandom / random.hh
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pilot / ralford / archive / old_applications / membrane_relax2.ccrandom / random.hh
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pilot / ralford / archive / old_applications / membrane_sampling.ccxyz.functions.hh
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pilot / olli / r_assign_clusters.ccrandom / random.hh
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pilot / olli / r_convert_frags.ccrandom / random.hh
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pilot / olli / r_frag_picker.ccangle.functions.hh
pilot / olli / r_frag_picker.ccconversions.hh
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pilot / olli / r_local_rdc.ccconversions.hh
pilot / olli / r_parse_foldtree.ccangle.functions.hh
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pilot / olungu / Superimpose_Pdbs.ccxyzVector.hh
pilot / opt_e / optE_simple.ccxyzVector.hh
pilot / opt_e / optE_simple.ccrandom / random.hh
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pilot / optE / optE_simple.ccrandom / random.hh
pilot / kale / kic_refactor / original / perturb_LoopMover_KIC.ccrandom / random.hh
pilot / kale / kic_refactor / original / refine_LoopMover_KIC.ccrandom / random.hh
pilot / parin / parin_test.ccxyzVector.hh
pilot / parin / parin_test.ccconversions.hh
public / pepspec / pepspec.ccrandom / random.hh
public / pepspec / pepspec_anchor_dock.ccconversions.hh
public / pepspec / pepspec_anchor_dock.ccxyzVector.hh
public / pepspec / pepspec_anchor_dock.ccrandom / random.hh
public / pepspec / pepspec_anchor_dock.ccrandom / random_permutation.hh
public / pepspec / pepspec_anchor_dock.ccNumericTraits.hh
public / pepspec / pepspec_anchor_dock.ccnumeric.functions.hh
pilot / doug / peptoid_rotlibs / peptoid_rotlib_test2.ccnumeric.functions.hh
pilot / doug / peptoid_rotlibs / peptoid_rotlib_test2.ccangle.functions.hh
benchmark / performance / performance_benchmark.ccrandom / random.hh
pilot / phil / capri15.ccxyzVector.hh
pilot / phil / capri15.ccxyzMatrix.hh
pilot / phil / capri15.ccxyz.functions.hh
pilot / phil / capri15.ccrandom / random.hh
pilot / phil / capri15.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / phil / capri15_scoring.hhxyzVector.hh
pilot / phil / capri15_scoring.hhxyzMatrix.hh
pilot / phil / capri15_scoring.hhxyz.functions.hh
pilot / phil / capri15_scoring.hhrandom / random.hh
pilot / phil / capri15_scoring.hhrandom / random_permutation.hh
pilot / phil / dimer_relax.ccrandom / random.hh
pilot / phil / dna_design_test.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / phil / dna_dr_test.ccxyzVector.hh
pilot / phil / dna_dr_test.ccxyzMatrix.hh
pilot / phil / dna_dr_test.ccxyz.functions.hh
pilot / phil / dna_dr_test.ccrandom / random.hh
pilot / phil / dna_relax.ccrandom / random.hh
pilot / phil / dna_relax.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / phil / dna_spec_test.ccxyzVector.hh
pilot / phil / dna_spec_test.ccxyzMatrix.hh
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pilot / phil / loop_model.hhxyzVector.hh
pilot / phil / loop_model.hhxyzMatrix.hh
pilot / phil / loop_model.hhxyz.functions.hh
pilot / phil / loop_model.hhrandom / random.hh
pilot / phil / loop_model.hhrandom / random_permutation.hh
pilot / phil / motif_scan.ccxyzVector.hh
pilot / phil / motif_scan.ccxyzMatrix.hh
pilot / phil / motif_scan.ccrandom / random.hh
pilot / phil / phil.hhxyzVector.hh
pilot / phil / phil.hhxyzMatrix.hh
pilot / phil / phil.hhxyz.functions.hh
pilot / phil / phil.hhconversions.hh
pilot / phil / phil.hhrandom / random.hh
pilot / phil / simple_dna_regression_test.ccxyzVector.hh
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pilot / phil / simple_dna_regression_test.ccxyz.functions.hh
pilot / phil / simple_dna_regression_test.ccrandom / random.hh
pilot / phil / test1.ccrandom / random.hh
pilot / phil / test1.ccconversions.hh
pilot / phil / zf_relax.ccrandom / random.hh
public / pose_sewing / MakeSegmentFile.ccrandom / random.hh
public / pose_sewing / MakeSegmentFile.ccHomogeneousTransform.hh
pilot / ptconway / elec_dens_rot_recov.ccxyzVector.hh
pilot / ptconway / elec_dens_rot_recov.ccrandom / random.hh
public / minimize_ppi.ccmodel_quality / rms.hh
public / struc_set_fragment_picker.ccrandom / random.hh
pilot / will / old / query_lang / metric.ccrandom / random.hh
pilot / ragul / get_pharmacophore_without_bound_rna.ccxyzVector.hh
pilot / ragul / get_pharmacophore_without_bound_rna.ccxyz.functions.hh
pilot / ragul / ragul_darc_minimize.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / ragul / ragul_darc_optimize_weights.ccconversions.hh
pilot / ragul / ragul_darc_optimize_weights.ccxyz.functions.hh
pilot / ragul / ragul_darc_optimize_weights.ccxyzMatrix.hh
pilot / rayyrw / closability_score.hhHomogeneousTransform.hh
pilot / rayyrw / FragMonteCarlo.hhrandom / random.hh
pilot / rayyrw / min_pack_min.hhxyzMatrix.hh
pilot / rayyrw / min_pack_min.hhxyzVector.hh
pilot / rayyrw / min_pack_min.hhxyzVector.io.hh
pilot / rayyrw / place_fragments_into_density.ccxyzMatrix.hh
pilot / rayyrw / place_fragments_into_density.ccxyzVector.hh
pilot / rayyrw / place_fragments_into_density.ccxyzVector.io.hh
pilot / reggiano / density_res_zscores.ccxyzMatrix.hh
pilot / reggiano / density_res_zscores.ccxyzVector.hh
pilot / reggiano / density_res_zscores.ccxyzVector.io.hh
pilot / reggiano / density_res_zscores.ccrandom / random.hh
pilot / rhiju / benzene_test.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / benzene_test.ccconversions.hh
pilot / rhiju / block_stack_test.ccxyz.functions.hh
pilot / rhiju / check_cubic_conv.ccMathNTensor.hh
pilot / rhiju / check_cubic_conv.ccinterpolation / polycubic_catmull_rom.hh
pilot / rhiju / check_cubic_conv.ccconstants.hh
pilot / rhiju / coarse_rna_test.cckinematic_closure / bridgeObjects.hh
pilot / rhiju / coarse_rna_test.cckinematic_closure / kinematic_closure_helpers.hh
pilot / rhiju / coarse_rna_test.ccxyzVector.hh
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pilot / rhiju / coarse_rna_test.ccrandom / random.hh
pilot / rhiju / coarse_rna_test.ccconversions.hh
pilot / rhiju / easy_target_test.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / easy_target_test.ccconversions.hh
pilot / rhiju / entropy_test.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / entropy_test.ccconversions.hh
pilot / rhiju / entropy_test.ccrandom / random.hh
pilot / rhiju / entropy_test.ccxyz.functions.hh
pilot / rhiju / entropy_test.ccangle.functions.hh
pilot / rhiju / gcc185_test.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / gcc185_test.ccrandom / random.hh
pilot / rhiju / gcc185_test.ccconversions.hh
pilot / rhiju / get_info.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / loop_closure_test.cckinematic_closure / bridgeObjects.hh
pilot / rhiju / loop_closure_test.cckinematic_closure / kinematic_closure_helpers.hh
pilot / rhiju / loop_closure_test.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / loop_closure_test.ccconversions.hh
pilot / rhiju / loop_closure_test.ccrandom / random.hh
pilot / rhiju / loop_closure_test.ccxyz.functions.hh
pilot / rhiju / loop_closure_test.ccangle.functions.hh
pilot / rhiju / mg_hires_pdbstats.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / mg_hires_pdbstats.ccxyzMatrix.hh
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pilot / rhiju / mg_hires_pdbstats.ccconversions.hh
pilot / rhiju / mg_lores_pdbstats.ccxyzVector.hh
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pilot / rhiju / mg_lores_pdbstats.ccconversions.hh
pilot / rhiju / mg_lores_pdbstats.ccxyz.functions.hh
pilot / rhiju / morph_pdbs.ccangle.functions.hh
pilot / rhiju / pack_phosphates.ccxyz.functions.hh
pilot / rhiju / pdbstats_rnahelix.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / pdbstats_rnahelix.ccxyzMatrix.hh
pilot / rhiju / pdbstats_rnahelix.ccconversions.hh
pilot / rhiju / pdbstats_rnahelix.ccxyz.functions.hh
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pilot / rhiju / pdbstats_test.ccconversions.hh
pilot / rhiju / pdbstats_test.ccxyz.functions.hh
pilot / rhiju / polar_pdbstats.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / polar_pdbstats.ccxyzMatrix.hh
pilot / rhiju / polar_pdbstats.ccconversions.hh
pilot / rhiju / polar_pdbstats.ccxyz.functions.hh
pilot / rhiju / protein_helix_assemble.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / protein_helix_assemble.ccconversions.hh
pilot / rhiju / protein_helix_assemble.ccrandom / random.hh
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pilot / rhiju / rb_entropy.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / rb_entropy.ccrandom / random_xyz.hh
pilot / rhiju / rb_entropy.ccrandom / random.hh
pilot / rhiju / rb_entropy.ccconstants.hh
pilot / rhiju / read_tensor.ccMathNTensor_io.hh
pilot / rhiju / read_tensor.ccinterpolation / spline / PolycubicSpline.hh
pilot / rhiju / read_tensor.ccinterpolation / spline / PolycubicSpline.tmpl.hh
pilot / rhiju / read_tensor.ccinterpolation / interpolation.hh
pilot / rhiju / read_tensor.ccxyzVector.io.hh
pilot / rhiju / rna_assemble_test.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / rna_assemble_test.ccconversions.hh
pilot / rhiju / rna_protein_test.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / rna_protein_test.ccrandom / random.hh
pilot / rhiju / rna_protein_test.ccNumericTraits.hh
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pilot / rhiju / rna_test.ccxyz.functions.hh
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pilot / rhiju / stepwise_centroid_test.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / stepwise_centroid_test.ccconversions.hh
pilot / rhiju / stepwise_centroid_test.ccrandom / random.hh
pilot / rhiju / stepwise_centroid_test.ccxyz.functions.hh
pilot / rhiju / stepwise_helix_test.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / stepwise_helix_test.ccconversions.hh
pilot / rhiju / stepwise_helix_test.ccxyz.functions.hh
pilot / rhiju / stepwise_loop_test.cckinematic_closure / bridgeObjects.hh
pilot / rhiju / stepwise_loop_test.cckinematic_closure / kinematic_closure_helpers.hh
pilot / rhiju / stepwise_loop_test.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / stepwise_loop_test.ccconversions.hh
pilot / rhiju / stepwise_loop_test.ccrandom / random.hh
pilot / rhiju / stepwise_loop_test.ccxyz.functions.hh
pilot / rhiju / stepwise_loop_test.ccangle.functions.hh
pilot / rhiju / stepwise_template_test.ccxyzVector.hh
pilot / rhiju / stepwise_template_test.ccconversions.hh
pilot / rhiju / stepwise_template_test.ccrandom / random.hh
pilot / rhiju / stepwise_template_test.ccxyz.functions.hh
pilot / rhiju / stepwise_template_test.ccangle.functions.hh
pilot / rjha / MetalInterface.hhxyzVector.hh
pilot / rjha / MetalInterfaceStructureCreator.ccxyzVector.hh
pilot / rjha / ZincMatchFilter.ccxyzVector.hh
pilot / rjha / ZincMatchFilter.ccconversions.hh
pilot / rjha / ZincMatchFilter.ccxyz.functions.hh
pilot / rmoretti / atom_tree_check.ccxyzVector.io.hh
pilot / rmoretti / bootstrap_bcl_types.ccutil.hh
pilot / rmoretti / extract_atomtree_diffs_jd1.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / rmoretti / ligand_dock_jd1.ccrandom / random.hh
pilot / rmoretti / ligand_dock_jd1.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / ronj / hydrophobic_patch_stats_calculator.ccxyzVector.hh
pilot / ronj / hydrophobic_patch_stats_calculator.ccconstants.hh
pilot / ronj / rss_energy_calculator.ccrandom / random.hh
pilot / rpache / generate_matcher_constraints.ccxyz.functions.hh
pilot / rpache / generate_matcher_constraints.ccconstants.hh
pilot / rvernon / calc_pair_stats.ccrandom / random.hh
pilot / rvernon / compute_disulfide_matching_score.ccconstants.hh
pilot / rvernon / compute_disulfide_matching_score.ccrandom / random.hh
pilot / rvernon / compute_disulfide_matching_score.ccxyzMatrix.hh
pilot / rvernon / compute_disulfide_matching_score.ccxyzMatrix.fwd.hh
pilot / rvernon / compute_disulfide_matching_score.ccxyz.functions.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_alldata.ccconstants.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_alldata.ccrandom / random.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_alldata.ccxyzMatrix.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_alldata.ccxyzMatrix.fwd.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_alldata.ccxyz.functions.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_angle_statistics.ccconstants.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_angle_statistics.ccrandom / random.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_angle_statistics.ccxyzMatrix.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_angle_statistics.ccxyzMatrix.fwd.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_angle_statistics.ccxyz.functions.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_database.ccrandom / random.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_database.ccxyzMatrix.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_database.ccxyzMatrix.fwd.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_database.ccxyz.functions.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_distance_statistics.ccconstants.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_distance_statistics.ccrandom / random.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_distance_statistics.ccxyzMatrix.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_distance_statistics.ccxyzMatrix.fwd.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_distance_statistics.ccxyz.functions.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_fa_angle_statistics.ccconstants.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_fa_angle_statistics.ccrandom / random.hh
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pilot / rvernon / create_disulfide_fa_angle_statistics.ccxyzMatrix.fwd.hh
pilot / rvernon / create_disulfide_fa_angle_statistics.ccxyz.functions.hh
pilot / rvernon / pcs_distances_for_fragpicker.ccconstants.hh
pilot / rvernon / pcs_distances_for_fragpicker.ccrandom / random.hh
pilot / rvernon / pcs_distances_for_fragpicker.ccxyzMatrix.hh
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pilot / rvernon / pcs_fragments_to_distances.ccconstants.hh
pilot / rvernon / pcs_fragments_to_distances.ccrandom / random.hh
pilot / rvernon / pcs_fragments_to_distances.ccxyzMatrix.hh
pilot / rvernon / pcs_fragments_to_distances.ccxyzMatrix.fwd.hh
pilot / rvernon / pcs_fragments_to_distances.ccxyz.functions.hh
pilot / rvernon / pcs_fragments_to_distances2.ccconstants.hh
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pilot / rvernon / pcs_fragments_to_distances2.ccxyzMatrix.hh
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pilot / rvernon / pcs_fragments_to_distances_wRMS.ccconstants.hh
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pilot / rvernon / pcs_fragments_to_distances_wRMS.ccxyzMatrix.fwd.hh
pilot / rvernon / pcs_fragments_to_distances_wRMS.ccxyz.functions.hh
pilot / rvernon / pcs_score_individual_residues.ccrandom / random.hh
pilot / rvernon / pcs_score_individual_residues.ccxyzMatrix.hh
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pilot / rvernon / pcs_score_residues.ccrandom / random.hh
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pilot / rvernon / pcs_score_residues.ccxyz.functions.hh
pilot / rvernon / pcs_score_select.ccrandom / random.hh
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pilot / rvernon / pcs_score_select.ccxyzMatrix.fwd.hh
pilot / rvernon / pcs_score_select.ccxyz.functions.hh
pilot / rvernon / pcs_score_select_helices.ccrandom / random.hh
pilot / rvernon / pcs_score_select_helices.ccxyzMatrix.hh
pilot / rvernon / pcs_score_select_helices.ccxyzMatrix.fwd.hh
pilot / rvernon / pcs_score_select_helices.ccxyz.functions.hh
pilot / rvernon / score_sidechain_sasa.ccrandom / random.hh
public / scenarios / ca_to_allatom.ccxyzVector.io.hh
pilot / ralford / archive / framework_devel / scoring / mp_scoring_feature_reporter.ccxyzVector.hh
pilot / ralford / archive / framework_devel / scoring / mp_sfxn_integration.ccxyzVector.hh
pilot / sergey / GA.ccrandom / random.hh
pilot / sergey / GA.ccNumericTraits.hh
pilot / sergey / OptionsTest.ccrandom / random.hh
pilot / sergey / PDBTest.ccxyzVector.hh
pilot / sergey / TracerTest.ccrandom / random.hh
public / sewing / segment_file_generator.ccrandom / random.hh
pilot / shilei / docking_inputpatchdock_mpi.ccxyzMatrix.hh
pilot / shilei / docking_inputpatchdock_mpi.ccangle.functions.hh
pilot / shilei / docking_inputpatchdock_mpi.ccrandom / random.hh
pilot / shilei / docking_parallel.ccxyzMatrix.hh
pilot / shilei / docking_parallel.ccangle.functions.hh
pilot / shilei / docking_parallel.ccrandom / random.hh
pilot / shilei / generate_hbond_geometry.ccconstants.hh
pilot / shilei / generate_hbond_geometry.ccconversions.hh
pilot / shilei / match_disulfide_to_scaffold.ccxyz.functions.hh
pilot / shilei / match_disulfide_to_scaffold.ccxyz.io.hh
pilot / shilei / match_disulfide_to_scaffold.ccxyzVector.hh
pilot / shilei / read_pose_jump_orientation_repack.ccxyzMatrix.hh
pilot / shirst / TestTopologySampler.ccrandom / random.hh
pilot / smlewis / UBQ_UBQ_E2.ccconversions.hh
pilot / smlewis / UBQ_UBQ_E2.ccxyz.io.hh
pilot / sraman / RBSegMove_test.ccrandom / random.hh
pilot / sraman / RBSegMove_test.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / sraman / RBSegMove_test_viewer.ccrandom / random.hh
pilot / sraman / RBSegMove_test_viewer.ccrandom / random_permutation.hh
pilot / sthyme / ligand_motifs.ccxyzVector.hh
pilot / sthyme / ligand_motifs.ccrandom / random.hh
pilot / jadolfbr / testing / test_grafting.ccrandom / random.hh
tests / test_CCD_loop_closure.ccrandom / random.hh
pilot / tjacobs / BundleDumper.ccxyzVector.hh
pilot / tjacobs / BundleDumper.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / tjacobs / BundlePairRmsdCalculator.ccxyzVector.hh
pilot / tjacobs / BundlePairRmsdCalculator.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / tjacobs / BundlePairRmsdCalculatorGPU.ccxyzVector.hh
pilot / tjacobs / BundlePairRmsdCalculatorGPU.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / tjacobs / CompareBundleToNative.ccxyzVector.hh
pilot / tjacobs / CompareBundleToNative.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / tjacobs / InterfaceStrandFinderMover.ccxyzVector.hh
pilot / tjacobs / model_dumper.ccrandom / random.hh
pilot / tjacobs / NodePairRmsdCalculator.ccxyzVector.hh
pilot / tjacobs / NodePairRmsdCalculator.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / tjacobs / PrepareGraphNodes.ccxyzVector.hh
pilot / tjacobs / PrepareGraphNodes.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / tjacobs / SmotifPairRmsdCalculatorGPU.CCxyzVector.hh
pilot / tjacobs / SmotifPairRmsdCalculatorGPU.CCmodel_quality / rms.hh
pilot / tseng / tseng_minimize.ccrandom / random.hh
public / rna / util / rna_database.ccconversions.hh
public / rna / util / rna_features.ccxyzMatrix.hh
public / rna / util / rna_score.ccconversions.hh
pilot / jackmaguire / vlmmlr_packer / FixbbSimAnnealer.ccrandom / random.hh
pilot / vmullig / bettercluster.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / vmullig / bettercluster.ccEulerAngles.hh
pilot / vmullig / bettercluster.ccPCA.hh
pilot / vmullig / cycpep_analysis.ccangle.functions.hh
pilot / vmullig / design_cycpeptide_MPI.ccxyz.functions.hh
pilot / vmullig / design_cycpeptide_MPI.ccrandom / random.hh
pilot / vmullig / design_cycpeptide_MPI.ccxyzVector.hh
pilot / vmullig / design_truecycpeptide_fromstub.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / vmullig / design_truecycpeptide_fromstub.ccrandom / random.hh
pilot / vmullig / fit_helixparams.ccxyz.functions.hh
pilot / vmullig / fit_helixparams.ccconversions.hh
pilot / vmullig / fit_helixparams.cccrick_equations / HelixParams.hh
pilot / vmullig / make_betahelicalbundle.ccrandom / random.hh
pilot / vmullig / make_betahelicalbundle.ccrandom / uniform.hh
pilot / vmullig / make_betahelicalbundle.ccconstants.hh
pilot / vmullig / make_helicalbundle.ccrandom / random.hh
pilot / vmullig / make_helicalbundle.ccrandom / uniform.hh
pilot / vmullig / make_ideal_betapeptide.ccrandom / random.hh
pilot / vmullig / make_ideal_betapeptide.ccrandom / uniform.hh
pilot / vmullig / make_truecyclicpeptide.ccxyz.functions.hh
pilot / vmullig / make_truecyclicpeptide.ccxyz.io.hh
pilot / vmullig / make_truecyclicpeptide.ccrandom / random.hh
pilot / vmullig / make_truecyclicpeptide.ccrandom / uniform.hh
pilot / vmullig / PCA_internal_test.ccPCA.hh
pilot / vmullig / PCA_visualizer.ccEulerAngles.hh
pilot / vmullig / symmetrize_3d_ramamap.ccangle.functions.hh
pilot / vmullig / symmetrize_new_ramamap.ccangle.functions.hh
pilot / vmullig / symmetrize_old_ramamap.ccangle.functions.hh
pilot / vmullig / test_cyclic_rama.ccxyz.functions.hh
pilot / vmullig / test_cyclic_rama.ccxyz.io.hh
pilot / vmullig / test_cyclic_rama.ccrandom / random.hh
pilot / vmullig / test_cyclic_rama.ccrandom / uniform.hh
pilot / vmullig / test_D_scoring.ccxyz.functions.hh
pilot / vmullig / test_D_scoring.ccxyz.io.hh
pilot / vmullig / test_D_scoring.ccrandom / random.hh
pilot / vmullig / test_D_scoring.ccrandom / uniform.hh
pilot / vmullig / test_KIC_betapeptide.ccrandom / random.hh
pilot / vmullig / test_KIC_betapeptide.ccrandom / uniform.hh
pilot / vmullig / test_makebundle_mover.ccconstants.hh
pilot / vmullig / test_metalloproteins.ccxyz.functions.hh
pilot / vmullig / test_metalloproteins.ccxyz.io.hh
pilot / vmullig / test_metalloproteins.ccrandom / random.hh
pilot / vmullig / test_metalloproteins.ccrandom / uniform.hh
pilot / vmullig / test_sidechainKIC.ccxyz.functions.hh
pilot / vmullig / test_sidechainKIC.ccxyz.io.hh
pilot / vmullig / test_sidechainKIC.ccrandom / random.hh
pilot / vmullig / test_sidechainKIC.ccrandom / uniform.hh
public / weight_optimization / torsional_potential_corrections.ccfourier / FFT.hh
public / weight_optimization / torsional_potential_corrections.ccxyzVector.hh
pilot / wendao / calc_stress_tensor.ccxyzVector.hh
pilot / wendao / calc_stress_tensor.ccxyzMatrix.hh
pilot / wendao / calc_stress_tensor.ccxyz.functions.hh
pilot / wendao / cenrot_bbsc_demo.ccrandom / random.hh
pilot / wendao / cenrot_bbsc_demo.ccconstants.hh
pilot / wendao / cenrot_jd2.ccrandom / random.hh
pilot / wendao / cyclic_sampler.ccrandom / random.hh
pilot / wendao / cyclic_sampler.ccconstants.hh
pilot / wendao / fa_to_cenrot_score.ccrandom / random.hh
pilot / wendao / fa_to_cenrot_score.ccconstants.hh
pilot / wendao / gen_cav_ball.ccxyz.functions.hh
pilot / wendao / general_pair_counting.ccrandom / random.hh
pilot / wendao / general_pair_counting.ccconstants.hh
pilot / wendao / general_pair_counting.ccxyz.functions.hh
pilot / wendao / params_opt.ccrandom / random.hh
pilot / wendao / test_bbmc.ccrandom / random.hh
pilot / wendao / test_bbmc.ccMultiDimensionalHistogram.hh
pilot / wendao / test_cen_rot.ccrandom / random.hh
pilot / wendao / test_cen_rot.ccconstants.hh
pilot / will / sym_multicomp_test.ccxyz.functions.hh
pilot / woodsh / mp_optimize_geometry_params.ccxyzVector.hh
pilot / woodsh / mp_transition_bfactor.ccxyzVector.hh
pilot / woodsh / set_radius.ccxyzVector.hh
pilot / wujsean / graft_ligand.ccxyzVector.hh
pilot / yfsong / challenge.ccrandom / random.hh
pilot / yfsong / challenge.ccmodel_quality / rms.hh
pilot / yfsong / challenge.ccmodel_quality / maxsub.hh
pilot / yfsong / PB_potential.ccxyz.functions.hh
pilot / yfsong / PB_potential.ccxyzMatrix.hh
pilot / yfsong / PB_potential.ccxyzVector.hh
pilot / yiliu / AbinitioClassic.ccrandom / random.hh
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