Rosetta

old → basic Relation

File in src/apps/pilot/will/oldIncludes file in src/basic
atom_design.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
atom_design.ccoptions / option.hh
atom_design.ccTracer.hh
atom_type_rdf.ccdatacache / BasicDataCache.hh
atom_type_rdf.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
atom_type_rdf.ccoptions / option.hh
atom_type_rdf.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
bpy.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
bpy.ccdatabase / open.hh
bpy.ccoptions / option.hh
bpy.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
bpy.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
bpy.ccTracer.hh
bpy.ccoptions / util.hh
cluster_cyc_disulf.ccoptions / keys / cluster.OptionKeys.gen.hh
cluster_cyc_disulf.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
cluster_cyc_disulf.ccoptions / option.hh
cluster_cyc_disulf.ccoptions / option_macros.hh
cluster_cyc_disulf.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
cluster_cyc_disulf.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
coiled_coil.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
coiled_coil.ccdatabase / open.hh
coiled_coil.ccoptions / option.hh
coiled_coil.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
coiled_coil.ccTracer.hh
coiled_coil.ccoptions / util.hh
coiled_coil_zn.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
coiled_coil_zn.ccdatabase / open.hh
coiled_coil_zn.ccoptions / option.hh
coiled_coil_zn.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
coiled_coil_zn.ccTracer.hh
coiled_coil_zn.ccoptions / util.hh
crossmatch.ccoptions / keys / crossmatch.OptionKeys.gen.hh
crossmatch.ccoptions / keys / enzdes.OptionKeys.gen.hh
crossmatch.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
crossmatch.ccoptions / option.hh
crossmatch.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
crossmatch.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
crossmatch.ccTracer.hh
crossmatch.ccoptions / util.hh
crossmatch.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
crossmatch_3e.ccoptions / keys / crossmatch.OptionKeys.gen.hh
crossmatch_3e.ccoptions / keys / enzdes.OptionKeys.gen.hh
crossmatch_3e.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
crossmatch_3e.ccoptions / option.hh
crossmatch_3e.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
crossmatch_3e.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
crossmatch_3e.ccTracer.hh
crossmatch_3e.ccoptions / util.hh
crossmatch_3e.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
crossmatch_d2.ccoptions / keys / crossmatch.OptionKeys.gen.hh
crossmatch_d2.ccoptions / keys / enzdes.OptionKeys.gen.hh
crossmatch_d2.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
crossmatch_d2.ccoptions / option.hh
crossmatch_d2.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
crossmatch_d2.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
crossmatch_d2.ccTracer.hh
crossmatch_d2.ccoptions / util.hh
crossmatch_d2.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
CXdock.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
CXdock.ccdatabase / open.hh
CXdock.ccoptions / option_macros.hh
CXdock.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
CXdock.ccTracer.hh
cxdock_sheet.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
cxdock_sheet.ccdatabase / open.hh
cxdock_sheet.ccoptions / option_macros.hh
cxdock_sheet.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
cxdock_sheet.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
cxdock_sheet.ccTracer.hh
CXdock_TMP.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
CXdock_TMP.ccoptions / keys / matdes.OptionKeys.gen.hh
CXdock_TMP.ccdatabase / open.hh
CXdock_TMP.ccoptions / option.hh
CXdock_TMP.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
CXdock_TMP.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
CXdock_TMP.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
CXdock_TMP.ccTracer.hh
CXdock_TMP.ccoptions / util.hh
cycgly_bbg8t3a.ccoptions / after_opts.hh
cycgly_bbg8t3a.ccoptions / keys / backrub.OptionKeys.gen.hh
cycgly_bbg8t3a.ccbasic.hh
cycgly_bbg8t3a.ccoptions / keys / bbg.OptionKeys.gen.hh
cycgly_bbg8t3a.ccoptions / keys / cluster.OptionKeys.gen.hh
cycgly_bbg8t3a.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
cycgly_bbg8t3a.ccoptions / keys / mc.OptionKeys.gen.hh
cycgly_bbg8t3a.ccoptions / option.hh
cycgly_bbg8t3a.ccoptions / option_macros.hh
cycgly_bbg8t3a.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
cycgly_bbg8t3a.ccprof.hh
cycgly_bbg8t3a.ccTracer.hh
cycgly_canonical.ccoptions / after_opts.hh
cycgly_canonical.ccoptions / keys / backrub.OptionKeys.gen.hh
cycgly_canonical.ccoptions / keys / bbg.OptionKeys.gen.hh
cycgly_canonical.ccoptions / keys / cluster.OptionKeys.gen.hh
cycgly_canonical.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
cycgly_canonical.ccoptions / keys / mc.OptionKeys.gen.hh
cycgly_canonical.ccoptions / option.hh
cycgly_canonical.ccoptions / option_macros.hh
cycgly_canonical.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
cycgly_canonical.ccprof.hh
cycgly_canonical.ccTracer.hh
cycgly_superimpose.ccoptions / after_opts.hh
cycgly_superimpose.ccoptions / keys / backrub.OptionKeys.gen.hh
cycgly_superimpose.ccbasic.hh
cycgly_superimpose.ccoptions / keys / bbg.OptionKeys.gen.hh
cycgly_superimpose.ccoptions / keys / cluster.OptionKeys.gen.hh
cycgly_superimpose.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
cycgly_superimpose.ccoptions / keys / mc.OptionKeys.gen.hh
cycgly_superimpose.ccoptions / option.hh
cycgly_superimpose.ccoptions / option_macros.hh
cycgly_superimpose.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
cycgly_superimpose.ccprof.hh
cycgly_superimpose.ccTracer.hh
cycgly_target.ccoptions / after_opts.hh
cycgly_target.ccoptions / keys / backrub.OptionKeys.gen.hh
cycgly_target.ccbasic.hh
cycgly_target.ccoptions / keys / bbg.OptionKeys.gen.hh
cycgly_target.ccoptions / keys / cluster.OptionKeys.gen.hh
cycgly_target.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
cycgly_target.ccoptions / keys / mc.OptionKeys.gen.hh
cycgly_target.ccoptions / option.hh
cycgly_target.ccoptions / option_macros.hh
cycgly_target.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
cycgly_target.ccprof.hh
cycgly_target.ccTracer.hh
cycsamp.ccoptions / after_opts.hh
cycsamp.ccoptions / keys / backrub.OptionKeys.gen.hh
cycsamp.ccbasic.hh
cycsamp.ccoptions / keys / bbg.OptionKeys.gen.hh
cycsamp.ccoptions / keys / cluster.OptionKeys.gen.hh
cycsamp.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
cycsamp.ccoptions / keys / mc.OptionKeys.gen.hh
cycsamp.ccoptions / option.hh
cycsamp.ccoptions / option_macros.hh
cycsamp.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
cycsamp.ccoptions / keys / parser.OptionKeys.gen.hh
cycsamp.ccprof.hh
cycsamp.ccTracer.hh
d3_bpy_linker.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
d3_bpy_linker.ccdatabase / open.hh
d3_bpy_linker.ccoptions / option_macros.hh
d3_bpy_linker.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
d3_bpy_linker.ccTracer.hh
design_DL.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
design_DL.ccoptions / option.hh
design_DL.ccTracer.hh
design_frags.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
design_frags.ccoptions / option.hh
designability_stats.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
designability_stats.ccoptions / option.hh
designability_stats.ccoptions / option_macros.hh
designability_stats.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
disulf_frag_match.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
disulf_frag_match.ccoptions / option.hh
disulf_frag_match.ccoptions / option_macros.hh
disulf_frag_match.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
disulf_frag_match.ccTracer.hh
disulf_frag_search.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
disulf_frag_search.ccoptions / option.hh
disulf_frag_search.ccoptions / option_macros.hh
disulf_frag_search.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
disulf_frag_search.ccTracer.hh
disulf_stat.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
disulf_stat.ccoptions / option.hh
disulf_stat.ccTracer.hh
dock_asym.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
dock_asym.ccdatabase / open.hh
dock_asym.ccoptions / option_macros.hh
dock_asym.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
dock_asym.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
dock_asym.ccTracer.hh
dubois.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
dubois.ccdatabase / open.hh
dubois.ccoptions / option.hh
dubois.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
dubois.ccTracer.hh
dubois.ccoptions / util.hh
dubois_graft.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
dubois_graft.ccdatabase / open.hh
dubois_graft.ccoptions / option.hh
dubois_graft.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
dubois_graft.ccTracer.hh
dubois_graft.ccoptions / util.hh
dump_res.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
dump_res.ccdatabase / open.hh
dump_res.ccoptions / option.hh
dump_res.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
dump_res.ccTracer.hh
dump_res.ccoptions / util.hh
dxdock.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
dxdock.ccdatabase / open.hh
dxdock.ccoptions / option_macros.hh
dxdock.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
dxdock.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
dxdock.ccTracer.hh
dxdock_movie.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
dxdock_movie.ccdatabase / open.hh
dxdock_movie.ccoptions / option_macros.hh
dxdock_movie.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
dxdock_movie.ccTracer.hh
flail.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
flail.ccoptions / option.hh
flail.ccoptions / option_macros.hh
flail.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
fnd_dutton.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
fnd_dutton.ccoptions / option.hh
fnd_dutton.ccoptions / option_macros.hh
fnd_dutton.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
fnd_dutton.ccTracer.hh
for_tim.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
for_tim.ccoptions / option_macros.hh
frag_util.hhdatabase / open.hh
FunGroupTK.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
FunGroupTK.ccoptions / option.hh
FunGroupTK.ccTracer.hh
FunGroupTK_test.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
FunGroupTK_test.ccoptions / option.hh
FunGroupTK_test.ccTracer.hh
gen3bpy.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gen3bpy.ccoptions / option.hh
gen3bpy.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gen3bpy.ccTracer.hh
gen3bpy.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
gen_cyc_gly.ccoptions / option.hh
gen_cyc_gly.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gen_cyc_gly.ccTracer.hh
gen_cyc_gly_cst.ccoptions / option.hh
gen_cyc_gly_cst.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gen_cyc_gly_cst.ccTracer.hh
gen_d2.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gen_d2.ccoptions / option.hh
gen_d2.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gen_d2.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
gen_d2.ccTracer.hh
gen_d2.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
gen_d2_3his_ooc.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gen_d2_3his_ooc.ccoptions / option.hh
gen_d2_3his_ooc.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gen_d2_3his_ooc.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
gen_d2_3his_ooc.ccTracer.hh
gen_d2_3his_ooc.ccoptions / util.hh
gen_d2_3his_ooc.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
gen_d2_4his.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gen_d2_4his.ccoptions / option.hh
gen_d2_4his.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
gen_d2_4his.ccTracer.hh
gen_d2_4his.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
gen_d2_hhhc.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gen_d2_hhhc.ccoptions / option.hh
gen_d2_hhhc.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gen_d2_hhhc.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
gen_d2_hhhc.ccTracer.hh
gen_d2_hhhc.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
gen_disulf_homodimer.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gen_disulf_homodimer.ccdatabase / open.hh
gen_disulf_homodimer.ccoptions / option.hh
gen_disulf_homodimer.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gen_disulf_homodimer.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
gen_disulf_homodimer.ccTracer.hh
gen_disulf_homodimer.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
gen_homo_hc.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gen_homo_hc.ccoptions / option.hh
gen_homo_hc.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gen_homo_hc.ccTracer.hh
gen_trimer_disulf.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gen_trimer_disulf.ccoptions / option.hh
gen_trimer_disulf.ccoptions / option_macros.hh
gen_trimer_disulf.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gen_trimer_disulf.ccTracer.hh
gen_xtal_dimer_from_trimer.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gen_xtal_dimer_from_trimer.ccoptions / option.hh
gen_xtal_dimer_from_trimer.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gen_xtal_dimer_from_trimer.ccTracer.hh
genI213.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
genI213.ccoptions / option.hh
genI213.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
genI213.ccTracer.hh
genI213_2comp.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
genI213_2comp.ccoptions / keys / matdes.OptionKeys.gen.hh
genI213_2comp.ccoptions / option.hh
genI213_2comp.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
genI213_2comp.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
genI213_2comp.ccTracer.hh
genI213_2dsf.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
genI213_2dsf.ccoptions / option.hh
genI213_2dsf.ccTracer.hh
genI213_2dsf.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
genI213_gensym.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
genI213_gensym.ccoptions / keys / matdes.OptionKeys.gen.hh
genI213_gensym.ccoptions / option.hh
genI213_gensym.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
genI213_gensym.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
genI213_gensym.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
genI213_gensym.ccTracer.hh
genI213_gensym.ccoptions / util.hh
genI213_nocontacts.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
genI213_nocontacts.ccoptions / keys / matdes.OptionKeys.gen.hh
genI213_nocontacts.ccoptions / option.hh
genI213_nocontacts.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
genI213_nocontacts.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
genI213_nocontacts.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
genI213_nocontacts.ccTracer.hh
genmatch.ccoptions / keys / edensity.OptionKeys.gen.hh
genmatch.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
genmatch.ccdatabase / open.hh
genmatch.ccoptions / option.hh
genmatch.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
genmatch.ccoptions / keys / parser.OptionKeys.gen.hh
genmatch.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
genmatch.ccTracer.hh
genmatch.ccoptions / util.hh
genmatch.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
genmatch_3bpy.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
genmatch_3bpy.ccoptions / option.hh
genmatch_3bpy.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
genmatch_3bpy.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
genmatch_3bpy.ccTracer.hh
genmatch_3bpy.ccoptions / util.hh
genmatch_3bpy.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
genmatch_d6_bhhcg.ccoptions / keys / edensity.OptionKeys.gen.hh
genmatch_d6_bhhcg.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
genmatch_d6_bhhcg.ccdatabase / open.hh
genmatch_d6_bhhcg.ccoptions / option.hh
genmatch_d6_bhhcg.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
genmatch_d6_bhhcg.ccoptions / keys / parser.OptionKeys.gen.hh
genmatch_d6_bhhcg.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
genmatch_d6_bhhcg.ccTracer.hh
genmatch_d6_bhhcg.ccoptions / util.hh
genmatch_d6_bhhcg.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
genmatch_d6_bpy.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
genmatch_d6_bpy.ccoptions / option.hh
genmatch_d6_bpy.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
genmatch_d6_bpy.ccTracer.hh
genmatch_d6_bpy.ccoptions / util.hh
genmatch_d6_bpy.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
genmatch_m8.ccoptions / keys / edensity.OptionKeys.gen.hh
genmatch_m8.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
genmatch_m8.ccdatabase / open.hh
genmatch_m8.ccoptions / option.hh
genmatch_m8.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
genmatch_m8.ccoptions / keys / parser.OptionKeys.gen.hh
genmatch_m8.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
genmatch_m8.ccTracer.hh
genmatch_m8.ccoptions / util.hh
genmatch_m8.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
genP23.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
genP23.ccoptions / keys / matdes.OptionKeys.gen.hh
genP23.ccoptions / option.hh
genP23.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
genP23.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
genP23.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
genP23.ccTracer.hh
genP23.ccoptions / util.hh
gensym_3bpy_from_dimer.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gensym_3bpy_from_dimer.ccoptions / option.hh
gensym_3bpy_from_dimer.ccoptions / option_macros.hh
gensym_3bpy_from_dimer.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gensym_3bpy_from_dimer.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
gensym_3bpy_from_dimer.ccTracer.hh
gensym_3bpy_from_dimer.ccoptions / util.hh
gentetra.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gentetra.ccoptions / option.hh
gentetra.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gentetra.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
gentetra.ccTracer.hh
gentetra.ccoptions / util.hh
gentetra.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
gentetra_bpy_from_znhis.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gentetra_bpy_from_znhis.ccoptions / option.hh
gentetra_bpy_from_znhis.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gentetra_bpy_from_znhis.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
gentetra_bpy_from_znhis.ccTracer.hh
gentetra_bpy_from_znhis.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
gentetra_from_trimer.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gentetra_from_trimer.ccoptions / option.hh
gentetra_from_trimer.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gentetra_from_trimer.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
gentetra_from_trimer.ccTracer.hh
gentetra_from_trimer.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
getDistConstraints.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
getDistConstraints.ccoptions / option.hh
getDistConstraints.ccprof.hh
gpu / gpu_cbdock.ccoptions / keys / gpu.OptionKeys.gen.hh
gpu / gpu_cbdock.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gpu / gpu_cbdock.ccoptions / option.hh
gpu / gpu_cbdock.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gpu / gpu_cbdock.ccTracer.hh
gpu / gpu_cbdock.ccoptions / util.hh
gpu / gpu_linker.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gpu / gpu_linker.ccoptions / option.hh
gpu / gpu_linker.ccoptions / option_macros.hh
gpu / gpu_linker.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gpu / gpu_linker.ccTracer.hh
gpu / gpu_linker.ccoptions / util.hh
gpu / gpu_score.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gpu / gpu_score.ccoptions / option.hh
gpu / gpu_score.ccoptions / option_macros.hh
gpu / gpu_score.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gpu / gpu_score.ccTracer.hh
gpu / gpu_score.ccoptions / util.hh
gpu / gpu_test.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gpu / gpu_test.ccoptions / option.hh
gpu / gpu_test.ccoptions / option_macros.hh
gpu / gpu_test.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gpu / gpu_test.ccTracer.hh
gpu / gpu_test.ccoptions / util.hh
gpu / gpu_test_Mxform.ccoptions / keys / gpu.OptionKeys.gen.hh
gpu / gpu_test_Mxform.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
gpu / gpu_test_Mxform.ccoptions / option.hh
gpu / gpu_test_Mxform.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
gpu / gpu_test_Mxform.ccTracer.hh
gpu / gpu_test_Mxform.ccoptions / util.hh
hczndimer.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
hczndimer.ccdatabase / open.hh
hczndimer.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
hczndimer.ccTracer.hh
helix_assembly.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
helix_assembly.ccdatabase / open.hh
helix_assembly.ccoptions / option_macros.hh
helix_assembly.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
helix_assembly.ccTracer.hh
heterodock.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
heterodock.ccdatabase / open.hh
heterodock.ccoptions / option_macros.hh
heterodock.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
heterodock.ccTracer.hh
holes2_training_data.ccdatacache / BasicDataCache.hh
holes2_training_data.ccdatacache / CacheableString.hh
holes2_training_data.ccoptions / keys / holes.OptionKeys.gen.hh
holes2_training_data.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
holes2_training_data.ccoptions / option.hh
holes2_training_data.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
holes_pbpdb.ccoptions / keys / holes.OptionKeys.gen.hh
holes_pbpdb.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
holes_pbpdb.ccoptions / option.hh
holes_pbpdb.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
holes_pbpdb.ccprof.hh
holes_test.ccdatacache / BasicDataCache.hh
holes_test.ccdatacache / CacheableString.hh
holes_test.ccoptions / keys / holes.OptionKeys.gen.hh
holes_test.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
holes_test.ccdatabase / open.hh
holes_test.ccoptions / option.hh
holes_test.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
holes_test.ccTracer.hh
holes_training_data.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
holes_training_data.ccoptions / option.hh
holes_training_data.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
hubabinitio.ccoptions / keys / abinitio.OptionKeys.gen.hh
hubabinitio.ccoptions / keys / frags.OptionKeys.gen.hh
hubabinitio.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
hubabinitio.ccdatabase / open.hh
hubabinitio.ccoptions / option.hh
hubabinitio.ccoptions / option_macros.hh
hubabinitio.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
hubabinitio.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
hubabinitio.ccTracer.hh
hubabinitio.ccoptions / util.hh
hubdenovo.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
hubdenovo.ccdatabase / open.hh
hubdenovo.ccoptions / option.hh
hubdenovo.ccoptions / option_macros.hh
hubdenovo.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
hubdenovo.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
hubdenovo.ccTracer.hh
hubdenovo.ccoptions / util.hh
hubfragdesign.ccoptions / keys / abinitio.OptionKeys.gen.hh
hubfragdesign.ccoptions / keys / frags.OptionKeys.gen.hh
hubfragdesign.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
hubfragdesign.ccdatabase / open.hh
hubfragdesign.ccoptions / option.hh
hubfragdesign.ccoptions / option_macros.hh
hubfragdesign.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
hubfragdesign.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
hubfragdesign.ccTracer.hh
hubfragdesign.ccoptions / util.hh
IKFGDB.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
IKFGDB.ccoptions / option.hh
IKFGDB.ccTracer.hh
isct_test.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
isct_test.ccoptions / option.hh
isct_test.ccTracer.hh
make_symmetric_task_test.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
make_symmetric_task_test.ccoptions / option.hh
match_disulf.ccoptions / keys / docking.OptionKeys.gen.hh
match_disulf.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
match_disulf.ccoptions / option.hh
match_disulf.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
minimize.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
minimize.ccoptions / option.hh
minimize_cavities.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
minimize_cavities.ccoptions / option.hh
mkresfile_i213.ccdatacache / BasicDataCache.hh
mkresfile_i213.ccdatacache / CacheableString.hh
mkresfile_i213.ccoptions / keys / holes.OptionKeys.gen.hh
mkresfile_i213.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
mkresfile_i213.ccoptions / keys / matdes.OptionKeys.gen.hh
mkresfile_i213.ccdatabase / open.hh
mkresfile_i213.ccoptions / option.hh
mkresfile_i213.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
mkresfile_i213.ccoptions / keys / packing.OptionKeys.gen.hh
mkresfile_i213.ccoptions / keys / parser.OptionKeys.gen.hh
mkresfile_i213.ccoptions / keys / run.OptionKeys.gen.hh
mkresfile_i213.ccTracer.hh
motif_denovo_hb.ccoptions / keys / mh.OptionKeys.gen.hh
motif_denovo_hb.ccoptions / option_macros.hh
motif_denovo_hb.ccTracer.hh
motif_hash_util.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
motif_hash_util.ccoptions / keys / mh.OptionKeys.gen.hh
motif_hash_util.ccdatabase / open.hh
motif_hash_util.ccoptions / option_macros.hh
motif_hash_util.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
motif_hash_util.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
motif_hash_util.ccTracer.hh
nisod.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
nisod.ccdatabase / open.hh
nisod.ccoptions / option.hh
nisod.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
nisod.ccTracer.hh
nisod.ccoptions / util.hh
organopv.ccoptions / keys / edensity.OptionKeys.gen.hh
organopv.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
organopv.ccdatabase / open.hh
organopv.ccoptions / option.hh
organopv.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
organopv.ccoptions / keys / parser.OptionKeys.gen.hh
organopv.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
organopv.ccTracer.hh
organopv.ccoptions / util.hh
pack_ddg.ccoptions / option.hh
pack_ddg.ccTracer.hh
pack_ddg.ccoptions / util.hh
pack_stat_energy.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
pack_stat_energy.ccoptions / option.hh
pentcb.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
pentcb.ccoptions / keys / matdes.OptionKeys.gen.hh
pentcb.ccdatabase / open.hh
pentcb.ccoptions / option.hh
pentcb.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
pentcb.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
pentcb.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
pentcb.ccTracer.hh
pentcb.ccoptions / util.hh
pentcb_design.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
pentcb_design.ccoptions / keys / matdes.OptionKeys.gen.hh
pentcb_design.ccdatabase / open.hh
pentcb_design.ccoptions / option.hh
pentcb_design.ccoptions / option_macros.hh
pentcb_design.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
pentcb_design.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
pentcb_design.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
pentcb_design.ccTracer.hh
pentcb_design.ccoptions / util.hh
pentcb_test.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
pentcb_test.ccoptions / keys / matdes.OptionKeys.gen.hh
pentcb_test.ccdatabase / open.hh
pentcb_test.ccoptions / option.hh
pentcb_test.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
pentcb_test.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
pentcb_test.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
pentcb_test.ccTracer.hh
pentcb_test.ccoptions / util.hh
pilot_packstat.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
pilot_packstat.ccoptions / option.hh
pilot_packstat.ccoptions / keys / packstat.OptionKeys.gen.hh
pilot_packstat.ccTracer.hh
print_dunscores.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
print_dunscores.ccoptions / option.hh
print_dunscores.ccTracer.hh
rblinker.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
rblinker.ccdatabase / open.hh
rblinker.ccoptions / option.hh
rblinker.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
rblinker.ccoptions / keys / parser.OptionKeys.gen.hh
rblinker.ccTracer.hh
rblinker2.ccbasic.hh
rblinker2.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
rblinker2.ccdatabase / open.hh
rblinker2.ccoptions / option.hh
rblinker2.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
rblinker2.ccoptions / keys / parser.OptionKeys.gen.hh
rblinker2.ccoptions / keys / score.OptionKeys.gen.hh
rblinker2.ccTracer.hh
rblinker2_overlay_bound.ccbasic.hh
rblinker2_overlay_bound.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
rblinker2_overlay_bound.ccdatabase / open.hh
rblinker2_overlay_bound.ccoptions / option.hh
rblinker2_overlay_bound.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
rblinker2_overlay_bound.ccoptions / keys / parser.OptionKeys.gen.hh
rblinker2_overlay_bound.ccoptions / keys / score.OptionKeys.gen.hh
rblinker2_overlay_bound.ccTracer.hh
rblinker2_test.ccbasic.hh
rblinker2_test.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
rblinker2_test.ccdatabase / open.hh
rblinker2_test.ccoptions / option.hh
rblinker2_test.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
rblinker2_test.ccoptions / keys / parser.OptionKeys.gen.hh
rblinker2_test.ccoptions / keys / score.OptionKeys.gen.hh
rblinker2_test.ccTracer.hh
rescore_i213.ccdatacache / BasicDataCache.hh
rescore_i213.ccdatacache / CacheableString.hh
rescore_i213.ccoptions / keys / holes.OptionKeys.gen.hh
rescore_i213.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
rescore_i213.ccoptions / keys / matdes.OptionKeys.gen.hh
rescore_i213.ccdatabase / open.hh
rescore_i213.ccoptions / option.hh
rescore_i213.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
rescore_i213.ccoptions / keys / packing.OptionKeys.gen.hh
rescore_i213.ccoptions / keys / parser.OptionKeys.gen.hh
rescore_i213.ccoptions / keys / run.OptionKeys.gen.hh
rescore_i213.ccTracer.hh
rsd_canonical_units.ccoptions / keys / gpu.OptionKeys.gen.hh
rsd_canonical_units.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
rsd_canonical_units.ccoptions / option.hh
rsd_canonical_units.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
rsd_canonical_units.ccTracer.hh
rsd_canonical_units.ccoptions / util.hh
sasa_test.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
sasa_test.ccoptions / option.hh
sasa_test.ccprof.hh
scheme_v0_score.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
scheme_v0_score.ccoptions / option.hh
scheme_v0_score.ccoptions / option_macros.hh
scheme_v0_score.ccoptions / keys / sicdock.OptionKeys.gen.hh
scheme_v0_score.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
scheme_v0_score.ccTracer.hh
score_pdbs.ccoptions / option.hh
score_pdbs.ccTracer.hh
score_pdbs.ccoptions / util.hh
sf4_hash.ccoptions / keys / edensity.OptionKeys.gen.hh
sf4_hash.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
sf4_hash.ccdatabase / open.hh
sf4_hash.ccoptions / option.hh
sf4_hash.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
sf4_hash.ccoptions / keys / parser.OptionKeys.gen.hh
sf4_hash.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
sf4_hash.ccTracer.hh
sf4_hash.ccoptions / util.hh
sf4_hash.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
sicdock.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
sicdock.ccoptions / keys / mh.OptionKeys.gen.hh
sicdock.ccdatabase / open.hh
sicdock.ccoptions / option_macros.hh
sicdock.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
sicdock.ccsampling / orientations / QuaternionGrid.hh
sicdock.ccoptions / keys / sicdock.OptionKeys.gen.hh
sicdock.ccTracer.hh
smhybrid.ccoptions / keys / edensity.OptionKeys.gen.hh
smhybrid.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
smhybrid.ccdatabase / open.hh
smhybrid.ccoptions / option.hh
smhybrid.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
smhybrid.ccoptions / keys / parser.OptionKeys.gen.hh
smhybrid.ccoptions / keys / smhybrid.OptionKeys.gen.hh
smhybrid.ccTracer.hh
smhybrid.ccoptions / util.hh
sphere_hierarchy.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
sphere_hierarchy.ccdatabase / open.hh
sphere_hierarchy.ccoptions / option_macros.hh
sphere_hierarchy.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
sphere_hierarchy.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
sphere_hierarchy.ccTracer.hh
SphereSample.hhdatabase / open.hh
spiro.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
spiro.ccdatabase / open.hh
spiro.ccoptions / option.hh
spiro.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
spiro.ccTracer.hh
sup_test.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
sup_test.ccoptions / option.hh
symdock_enum_3_1.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
symdock_enum_3_1.ccoptions / option.hh
symdock_enum_3_1.ccoptions / option_macros.hh
symdock_enum_3_1.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
symdock_enum_3_1.ccoptions / keys / sicdock.OptionKeys.gen.hh
symdock_enum_3_1.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
symdock_enum_3_1.ccTracer.hh
symdock_hybrid.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
symdock_hybrid.ccoptions / option.hh
symdock_hybrid.ccTracer.hh
symdock_hybrid_cc3.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
symdock_hybrid_cc3.ccoptions / option.hh
symdock_hybrid_cc3.ccTracer.hh
tcdock.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
tcdock.ccoptions / keys / mh.OptionKeys.gen.hh
tcdock.ccdatabase / open.hh
tcdock.ccoptions / option.hh
tcdock.ccoptions / option_macros.hh
tcdock.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
tcdock.ccoptions / keys / sicdock.OptionKeys.gen.hh
tcdock.ccoptions / keys / symmetry.OptionKeys.gen.hh
tcdock.ccTracer.hh
test.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
test.ccoptions / option.hh
test_gradient.ccoptions / keys / holes.OptionKeys.gen.hh
test_ikrs.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
test_ikrs.ccoptions / keys / match.OptionKeys.gen.hh
test_ikrs.ccoptions / option.hh
test_ikrs.ccTracer.hh
test_ikrs2.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
test_ikrs2.ccoptions / keys / match.OptionKeys.gen.hh
test_ikrs2.ccoptions / option.hh
test_ikrs2.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
test_ikrs2.ccTracer.hh
test_ikrs2.ccoptions / util.hh
test_ikrs2.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
test_ikrs_flymake.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
test_ikrs_flymake.ccoptions / option.hh
test_ikrs_flymake.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
test_ikrs_flymake.ccTracer.hh
test_ikrs_flymake.ccoptions / util.hh
test_ikrs_flymake.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
test_kc.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
test_kc.ccoptions / option.hh
test_kc.ccTracer.hh
test_leerichards.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
test_leerichards.ccoptions / option.hh
test_leerichards.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
test_leerichards.ccoptions / keys / packstat.OptionKeys.gen.hh
test_loop_hash.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
test_loop_hash.ccoptions / option.hh
test_loop_hash.ccoptions / option_macros.hh
test_loop_hash.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
test_rose.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
test_rose.ccoptions / option.hh
test_sucker_energy.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
ward_design.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
ward_design.ccdatabase / open.hh
ward_design.ccoptions / option.hh
ward_design.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
ward_design.ccTracer.hh
ward_design.ccoptions / util.hh
will_mutalyze.ccdatacache / BasicDataCache.hh
will_mutalyze.ccdatacache / CacheableString.hh
will_mutalyze.ccoptions / keys / holes.OptionKeys.gen.hh
will_mutalyze.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
will_mutalyze.ccoptions / keys / matdes.OptionKeys.gen.hh
will_mutalyze.ccMetricValue.hh
will_mutalyze.ccdatabase / open.hh
will_mutalyze.ccoptions / option.hh
will_mutalyze.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
will_mutalyze.ccoptions / keys / packing.OptionKeys.gen.hh
will_mutalyze.ccoptions / keys / parser.OptionKeys.gen.hh
will_mutalyze.ccoptions / keys / run.OptionKeys.gen.hh
will_mutalyze.ccTracer.hh
willmatch_2d6_bhe.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
willmatch_2d6_bhe.ccoptions / option.hh
willmatch_2d6_bhe.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
willmatch_2d6_bhe.ccTracer.hh
willmatch_2d6_bhe.ccoptions / util.hh
willmatch_2d6_bhe.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
willmatch_chorismate.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
willmatch_chorismate.ccoptions / option.hh
willmatch_chorismate.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
willmatch_chorismate.ccTracer.hh
willmatch_chorismate.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
willmatch_d6_bpy.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
willmatch_d6_bpy.ccdatabase / open.hh
willmatch_d6_bpy.ccoptions / option.hh
willmatch_d6_bpy.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
willmatch_d6_bpy.ccTracer.hh
willmatch_d6_bpy.ccoptions / keys / willmatch.OptionKeys.gen.hh
xyzStripeHash_dump.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
xyzStripeHash_dump.ccoptions / option.hh
xyzStripeHash_dump.ccoptions / option_macros.hh
xyzStripeHash_dump.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
xyzStripeHash_dump.ccTracer.hh
xyzStripeHash_test.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
xyzStripeHash_test.ccoptions / option.hh
xyzStripeHash_test.ccoptions / option_macros.hh
xyzStripeHash_test.ccoptions / keys / out.OptionKeys.gen.hh
xyzStripeHash_test.ccTracer.hh
yeates_align.ccoptions / keys / in.OptionKeys.gen.hh
yeates_align.ccoptions / option.hh
yeates_align.ccTracer.hh
Generated on Fri Sep 12 2025 00:06:08 for Rosetta by doxygen 1.9.1