- i -

• i : Access , Atom , Bond , formatter< TupleT, Char, enable_if_t< fmt::is_tuple_like< TupleT >::value > >::format_each< FormatContext > , Integral , pseudoCAbond
• I1_ : ObjexxFCL::FArray2A< T > , ObjexxFCL::FArray2D< T > , ObjexxFCL::FArray2P< T > , ObjexxFCL::FArray3A< T > , ObjexxFCL::FArray3D< T > , ObjexxFCL::FArray3P< T > , ObjexxFCL::FArray4A< T > , ObjexxFCL::FArray4D< T > , ObjexxFCL::FArray4P< T > , ObjexxFCL::FArray5A< T > , ObjexxFCL::FArray5D< T > , ObjexxFCL::FArray5P< T > , ObjexxFCL::FArray6A< T > , ObjexxFCL::FArray6D< T > , ObjexxFCL::FArray6P< T > , ObjexxFCL::KeyFArray2D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray3D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray4D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray5D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray6D< T >
• I2_ : ObjexxFCL::FArray2A< T > , ObjexxFCL::FArray2D< T > , ObjexxFCL::FArray2P< T > , ObjexxFCL::FArray3A< T > , ObjexxFCL::FArray3D< T > , ObjexxFCL::FArray3P< T > , ObjexxFCL::FArray4A< T > , ObjexxFCL::FArray4D< T > , ObjexxFCL::FArray4P< T > , ObjexxFCL::FArray5A< T > , ObjexxFCL::FArray5D< T > , ObjexxFCL::FArray5P< T > , ObjexxFCL::FArray6A< T > , ObjexxFCL::FArray6D< T > , ObjexxFCL::FArray6P< T > , ObjexxFCL::KeyFArray2D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray3D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray4D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray5D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray6D< T >
• i2c_ : CrystFFTDock
• I3_ : ObjexxFCL::FArray3A< T > , ObjexxFCL::FArray3D< T > , ObjexxFCL::FArray3P< T > , ObjexxFCL::FArray4A< T > , ObjexxFCL::FArray4D< T > , ObjexxFCL::FArray4P< T > , ObjexxFCL::FArray5A< T > , ObjexxFCL::FArray5D< T > , ObjexxFCL::FArray5P< T > , ObjexxFCL::FArray6A< T > , ObjexxFCL::FArray6D< T > , ObjexxFCL::FArray6P< T > , ObjexxFCL::KeyFArray3D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray4D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray5D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray6D< T >
• I4_ : ObjexxFCL::FArray4A< T > , ObjexxFCL::FArray4D< T > , ObjexxFCL::FArray4P< T > , ObjexxFCL::FArray5A< T > , ObjexxFCL::FArray5D< T > , ObjexxFCL::FArray5P< T > , ObjexxFCL::FArray6A< T > , ObjexxFCL::FArray6D< T > , ObjexxFCL::FArray6P< T > , ObjexxFCL::KeyFArray4D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray5D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray6D< T >
• I5_ : ObjexxFCL::FArray5A< T > , ObjexxFCL::FArray5D< T > , ObjexxFCL::FArray5P< T > , ObjexxFCL::FArray6A< T > , ObjexxFCL::FArray6D< T > , ObjexxFCL::FArray6P< T > , ObjexxFCL::KeyFArray5D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray6D< T >
• I6_ : ObjexxFCL::FArray6A< T > , ObjexxFCL::FArray6D< T > , ObjexxFCL::FArray6P< T > , ObjexxFCL::KeyFArray6D< T >
• I_ : ObjexxFCL::FArray1A< T > , ObjexxFCL::FArray1D< T > , ObjexxFCL::FArray1P< T > , ObjexxFCL::KeyFArray1D< T >
• i_ : Packing_energies
• i__not_binded : Arrays
• i_not_binded : Access
• i_protected_not_binded : Access
• i_r : Pointers_and_References
• i_stream_ : utility::io::icstream
• ia : Base::InnerBase
• iacc_ : HBondedPairIterator
• IAM_ : IAMover , UBQ_E2Mover , UBQ_GTPase_disulfide_Mover
• ib : Base::InnerBase
• ich1 : Hit
• ich2 : Hit
• icmp1 : LMAX
• icmp2 : LMAX
• icys : Hit
• id : detail::named_arg_info< Char > , schema.Job
• id_ : numeric::ClusteringTreeNode , ScoreFragInfo , utility::keys::AutoKey< O, S, C > , utility::keys::UserKey< O, S, C >
• idctPlan : numeric::fourier::SHT
• ideal_geometry : erraser_option.erraser_option
• idealize_rings_ : DockGlycansProtocol
• identifier_ : utility::keys::AutoKey< O, S, C > , utility::keys::UserKey< O, S, C >
• idmr : Hit
• idon_ : HBondedPairIterator
• ids : binder::Context
• idsf : Hit
• idx_ : CAtrace , numeric::kdtree::CompareKDPoints
• if_stream_ : utility::io::izstream
• iface_candidates : MatchSet
• ifc_ : FunGroupTK , RotSel
• ifftPlan : numeric::fourier::SHT
• ig_ : core::pack::annealer::FixbbSimAnnealer , InteractionGraphPerformanceBenchmark
• ignore_errors : pyrosetta.distributed.cluster.core.PyRosettaCluster , pyrosetta.distributed.cluster.logging_listeners.SocketListener
• ignore_full_res_output_ : GlycanClashCheckMover
• ignore_hydrogens_ : GlycanClashCheckMover
• ihbr_ : HBondedPairIterator
• ihis : Hit
• ii_not_binded : Arrays
• iinfo : InterfaceHit
• image_stack_ : SimulateCryoMover
• implicit_bit : detail::fp
• in_file_ : ScoreEachBenchmark
• in_list_ : utility::list_element< T >
• in_map_ : basic::Emitter
• in_mem_ : MPInterfaceStatistics
• in_pdb_ : MPDomainAssembly
• incident_edge_list_ : utility::graph::DirectedNode , utility::graph::Node
• include_citation_info_ : utility::tag::XMLSchemaDefinition
• include_native : erraser_option.erraser_option
• include_neighbor_sc_ : protocols::antibody::design::AntibodyDesignMoverGenerator
• includes_ : binder::IncludeSet
• includes_to_add : binder::Config
• includes_to_skip : binder::Config
• indegree_ : utility::graph::DirectedNode
• indent_ : basic::Emitter
• indent_depth_ : basic::Emitter
• indent_str_ : basic::Emitter
• indentation_level_ : numeric::expression_parser::ASTPrinter , utility::json_spirit::Generator< Value_type, Ostream_type >
• index : detail::arg_ref< Char >::value , myspace::InputData , svm_node , SVR_Q , utility::graph::DS_Node
• index_ : Features , utility::graph::UEVertex< V, E > , utility::keys::AutoKey< O, S, C > , utility::keys::UserKey< O, S, C > , utility::libsvm::Svm_node_rosetta , utility::SimulateMPIMessage , VallIndex
• index_to_vd_ : utility::graph::RingDetection< Graph >
• indices_ : basic::database::schema_generator::Schema
• infiles_ : MPDomainAssembly
• Info : basic::Tracer , basic::TracerImpl
• info : numeric::nls::lm_status_struct
• info_ : numeric::linear_algebra::GeneralizedEigenSolver< _MatrixType >
• init_for_input_yet_ : AbInitio_MPI , FloppyTailMover , HECTMover , UBQ_E2Mover , UBQ_GTPase_disulfide_Mover
• init_pose_obj_ : protocols::abinitio::JumpSpecificAbrelax
• initial_repack_mover_ : HemeReplace
• initialize_ : LocalRmsd
• initialized_ : ObjexxFCL::Dimension , RosettaJob
• initializer_ : ObjexxFCL::FArray1D< T > , ObjexxFCL::FArray2D< T > , ObjexxFCL::FArray3D< T > , ObjexxFCL::FArray4D< T > , ObjexxFCL::FArray5D< T > , ObjexxFCL::FArray6D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray1D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray2D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray3D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray4D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray5D< T > , ObjexxFCL::KeyFArray6D< T >
• initials_ : basic::citation_manager::AuthorNames
• inner_cycles_ : CenRotDockingMover , SmoothFragRepackMover
• input_ : SequenceProfileDB
• input_file : schema.Job
• input_file_ : NativeEnsemble
• input_files : utility::Inline_File_Provider
• input_packed_pose : pyrosetta.distributed.cluster.core.PyRosettaCluster , pyrosetta.tests.distributed.cluster.test_smoke.ScoresTest , pyrosetta.tests.distributed.cluster.test_smoke.TestBase
• input_pdb : erraser_option.erraser_option
• input_pdb_ : InterfaceDDGBindInnerJob
• input_pose_count_ : JDmover
• input_pose_length_ : JDmover
• input_pose_sequence_ : JDmover
• insert_ : sidechain_cst_3.Residue
• insert_loop_end : APDBCMover
• insert_loop_start : APDBCMover
• insert_point : APDBCMover
• insertion_operators : binder::Context
• instance : pyrosetta.protocols.h5_fragment_store_provider.H5PyFragmentStoreProvider , pyrosetta.protocols.h5_structure_store_provider.H5StructureStoreProvider
• instance_ : GetURLHandler
• instance_kwargs : pyrosetta.tests.distributed.cluster.test_smoke.ScoresTest , pyrosetta.tests.distributed.cluster.test_smoke.TestBase
• int128_value : detail::value< Context >
• int_value : detail::value< Context >
• int_value_ : utility::py::Base
• integer_ : ObjexxFCL::DimensionExpressionCon
• integer_msg_ : utility::SimulateMPIMessage
• integer_vectors_ : utility::options::OptionCollection
• integers_ : utility::options::OptionCollection
• integers_msg_ : utility::SimulateMPIMessage
• integration_test_ : SimulateCryoMover
• intercept : numeric::interpolation::spline::LinearFunction
• interchain : ScoreBreakdown
• interface_analyzer_ : zinc1_homodimer_design , zinc2_homodimer_setup
• interface_dis_ : protocols::antibody::design::AntibodyDesignMoverGenerator
• interface_jump_ : CalcIrms
• interface_scorable_tree_ : zinc1_homodimer_design
• interface_tf_ : protocols::antibody::design::AntibodyDesignMoverGenerator
• interfacedist_ : CrystFFTDock
• InterfaceNeighborDefinition_ : HDdesignMover
• interfaces_ : MPInterfaceStatistics
• InterfaceSasaDefinition_ : UBQ_E2Mover , UBQ_GTPase_disulfide_Mover
• interp : numeric::interpolation::spline::interp_range
• interpolator_ : numeric::interpolation::Histogram< X, Y > , numeric::interpolation::spline::SplineGenerator
• interpolators_ : numeric::interpolation::spline::CompoundInterpolator
• interval : pyrosetta.tests.distributed.test_gil.HeartBeat
• intf_ : MPInterfaceStatistics
• intra_move1A_ : Arch
• intra_move1B_ : Arch
• intra_move2A_ : Arch
• intra_move2B_ : Arch
• intra_slide1_ : Arch
• intra_slide2_ : Arch
• intra_xform1_ : Arch
• intra_xform2_ : Arch
• intrachain : ScoreBreakdown
• inverse_ : numeric::fourier::kiss_fft_state , numeric::fourier::kiss_fftnd_state , numeric::fourier::kiss_fftndr_state
• iorb_ : HBondedPairIterator
• iori : Hit , LMAX
• ios_saver_ : utility::json_spirit::Generator< Value_type, Ostream_type >
• ip_not_binded : Consts , Pointers_and_References
• ipka_ : PhProtocol
• iqg : Hit
• ir : Hit
• iref : FitMover
• ires_ : RotateSAXS
• iResid_ : protocols::jumping::LibraryJumpSetup , protocols::jumping::SpecificJumpSetup
• irot : Hit
• irot1_ : HBondedPairIterator
• irot2_ : HBondedPairIterator
• irt : Hit
• is_aln_chain_ : CalcIrms
• is_append : erraser_option.erraser_option
• is_designable_ : PoseWrap
• is_fa_ : RescoreSAXS , RotateSAXS
• is_group_ : utility::options::Option
• is_literal_ : numeric::expression_parser::ArithmeticASTValue
• is_native_interface_ : CalcIrms
• is_option_group : options_class.Option
• is_packed : format_arg_store< Context, Args >
• is_repackable_ : PoseWrap
• is_required_ : utility::tag::XMLSchemaAttribute
• is_rgb : detail::color_type
• is_setup : pyrosetta.distributed.tasks.taskbase.TaskBase
• is_sformat_initialized : numeric::random::mt19937_RG
• is_sorted_ : HeapContainer< T, Comparator >
• isC1_ : pointGroupHit
• isC_ : pointGroupHit
• isCh_ : pointGroupHit
• isCi_ : pointGroupHit
• isCs_ : pointGroupHit
• isCv_ : pointGroupHit
• isD_ : pointGroupHit
• isDd_ : pointGroupHit
• isDh_ : pointGroupHit
• isDS_ : PairScore
• iseed_ : numeric::random::mt19937_RG
• isep_residue_ : CountContact
• islide : Hit
• isO_ : pointGroupHit
• iss : Hit
• isS_ : pointGroupHit
• isT_ : pointGroupHit
• it_ : utility::DereferenceIterator< Container >
• item_ : numeric::random::WeightedReservoirItem< T >
• iter_added_last_ : myspace::Scheduler
• iter_updated_last_ : myspace::Scheduler
• iteration : pyrosetta.distributed.utility.log.ProgressLogger , schema.Trajectory
• iterations : apps::pilot::KicSandbox , pyrosetta.distributed.utility.log.ProgressLogger , SamplingManager , schema.Job
• iterations_ : NativeEnsemble
• iters_ : utility::json_spirit::Stream_reader< Istream_type, Value_type > , utility::json_spirit::Stream_reader_thrower< Istream_type, Value_type >
• itype : Hit