denovo → stepwise Relation

File in src/protocols/rna/denovo	Includes file in src/protocols/stepwise
RNA_DeNovoPoseInitializer.cc	monte_carlo / util.hh
RNA_DeNovoProtocol.cc	modeler / rna / checker / RNA_VDW_BinChecker.hh
RNA_DeNovoProtocol.hh	modeler / rna / checker / RNA_VDW_BinChecker.fwd.hh
RNA_FragmentMonteCarlo.cc	modeler / rna / checker / RNA_VDW_BinChecker.hh
RNA_FragmentMonteCarlo.cc	modeler / align / util.hh
RNA_FragmentMonteCarlo.cc	modeler / util.hh
RNA_FragmentMonteCarlo.hh	modeler / rna / checker / RNA_VDW_BinChecker.fwd.hh
movers / RNA_DeNovoProtocolMover.cc	modeler / rna / checker / RNA_VDW_BinChecker.hh
movers / RNA_DeNovoProtocolMover.hh	modeler / rna / checker / RNA_VDW_BinChecker.fwd.hh
movers / RNA_Minimizer.cc	modeler / util.hh