- i -

• I : core::chemical::element , protocols::abinitio::abscript
• IC_RefineCCDStandard : protocols::loops::loop_mover::refine
• IC_RepackTrial : protocols::loops::loop_mover::refine
• IC_ShearMinCCDTrial : protocols::loops::loop_mover::refine
• IC_SmallMinCCDTrial : protocols::loops::loop_mover::refine
• iCode : protocols::loops
• IGNORE : core::select::residue_selector::slice_enums
• II : protocols::abinitio::abscript
• IIIa : protocols::abinitio::abscript
• IIIb : protocols::abinitio::abscript
• IMGT_Scheme : protocols::antibody
• In : core::chemical::element
• in : core::conformation::membrane
• Inclusive : protocols::features::RelevantResiduesMode
• INPUT_DOMAIN : core::pose::full_model_info
• input_pose_deallocation_msg : protocols::jd3::deallocation
• INPUT_STREAM : protocols::toolbox
• INTEGRATION_TEST : protocols::stepwise::screener
• INTERCALATED_T_LOOP : core::scoring::rna
• interchain_contact : core::scoring
• interchain_env : core::scoring
• interchain_pair : core::scoring
• interchain_vdw : core::scoring
• interface_dd_pair : core::scoring
• intermol : core::scoring
• INVALID : protocols::comparative_modeling::features
• INVALID_BEHAVIOUR : core::pack::palette
• INVALID_DOF : core::id
• INVALID_SS : protocols::comparative_modeling::features
• INVALID_t : core::chemical
• INVERTED_VIRTUAL_RESIDUE : core::chemical
• IOTA_ATOM : core::chemical
• Ir : core::chemical::element
• IsAromaticBond : core::chemical
• ISECT : core::scoring::packstat
• IVa : protocols::abinitio::abscript
• IVb : protocols::abinitio::abscript