Rosetta 3.5
 All Classes Namespaces Files Functions Variables Typedefs Enumerations Enumerator Friends Macros Pages
HBCountPairFunction.hh
Go to the documentation of this file.
1 // -*- mode:c++;tab-width:2;indent-tabs-mode:t;show-trailing-whitespace:t;rm-trailing-spaces:t -*-
2 // vi: set ts=2 noet:
3 //
4 // (c) Copyright Rosetta Commons Member Institutions.
5 // (c) This file is part of the Rosetta software suite and is made available under license.
6 // (c) The Rosetta software is developed by the contributing members of the Rosetta Commons.
7 // (c) For more information, see http://www.rosettacommons.org. Questions about this can be
8 // (c) addressed to University of Washington UW TechTransfer, email: license@u.washington.edu.
9 
10 /// @file core/scoring/trie/trie_vs_trie.hh
11 /// @brief
12 /// @author Andrew Leaver-Fay (aleaverfay@gmail.com)
13 
14 #ifndef INCLUDED_core_scoring_hbonds_hbtrie_HBCountPairFunction_hh
15 #define INCLUDED_core_scoring_hbonds_hbtrie_HBCountPairFunction_hh
16 
17 // Unit Headers
18 #include <core/scoring/hbonds/hbtrie/HBCountPairFunction.fwd.hh>
19 
20 // Package Headers
21 #include <core/scoring/etable/etrie/CountPairData_1_1.fwd.hh>
22 #include <core/scoring/etable/etrie/CountPairData_1_2.fwd.hh>
23 #include <core/scoring/etable/etrie/CountPairData_1_3.fwd.hh>
24 #include <core/scoring/etable/etrie/CountPairDataGeneric.fwd.hh>
25 #include <core/scoring/etable/etrie/EtableAtom.fwd.hh>
26 
27 #include <core/scoring/trie/TrieCountPairBase.hh>
28 #include <core/scoring/trie/RotamerTrie.fwd.hh>
29 
30 #include <core/scoring/hbonds/hbtrie/HBCPData.fwd.hh>
31 
32 #include <core/scoring/hbonds/HBondEnergy.fwd.hh>
33 
34 // ObjexxFLC Headers
35 #include <ObjexxFCL/FArray2D.fwd.hh>
36 
37 namespace core {
38 namespace scoring {
39 namespace hbonds {
40 namespace hbtrie {
41 
42 class HBCountPairFunction : public trie::TrieCountPairBase
43 {
44 public:
45  virtual ~HBCountPairFunction();
46  /// ------- USEFUL FUNCTIONS -------------///
47 
48  /// @brief This is the main function for enforcing the sc/bb hbond exclusion rule.
49  /// It works like this: the templated trie-vs-trie function asks this class (via it's operator() method)
50  /// whether two atoms should have their interactions counted. This is answered by the logic in here
51  /// that depends on two pieces of data. 1. whether an atom is a sidechain atom, and 2. whether
52  /// the other atom ought to avoid hbonds to sidechain atoms. This second boolean is true iff
53  /// a. the other atom is a backbone atom, b. the other atom is already participating in a bb/bb hbond, and
54  /// c. the sc/bb-hydrogen-bond-exclusion rule is being enforced.
55  template < class CPDATA1, class CPDATA2 >
56  bool operator () ( CPDATA1 at1dat, CPDATA2 at2dat, Real & /*weight*/, Size & /*path_dist*/ )
57  {
58  return ! ((at1dat.avoid_sc_hbonds() && at2dat.is_sc()) || (at2dat.avoid_sc_hbonds() && at1dat.is_sc()) );
59  }
60 
61  static
62  void
63  print();
64 
65  ///---------- TYPE RESOLUTION FUNCTIONS ----------///
66  virtual
67  void
68  resolve_trie_vs_trie(
69  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
70  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
71  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
72  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
73  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
74 
75  virtual
76  void
77  resolve_trie_vs_trie(
78  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
79  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
80  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
81  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
82  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
83 
84  virtual
85  void
86  resolve_trie_vs_trie(
87  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
88  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
89  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
90  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
91  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
92 
93  virtual
94  void
95  resolve_trie_vs_trie(
96  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
97  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
98  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
99  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
100  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
101 
102 
103  virtual
104  void
105  resolve_trie_vs_trie(
106  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
107  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
108  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
109  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
110  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
111 
112  virtual
113  void
114  resolve_trie_vs_trie(
115  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
116  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
117  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
118  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
119  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
120 
121  virtual
122  void
123  resolve_trie_vs_trie(
124  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
125  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
126  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
127  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
128  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
129 
130  virtual
131  void
132  resolve_trie_vs_trie(
133  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
134  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
135  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
136  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
137  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
138 
139 
140  virtual
141  void
142  resolve_trie_vs_trie(
143  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
144  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
145  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
146  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
147  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
148 
149  virtual
150  void
151  resolve_trie_vs_trie(
152  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
153  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
154  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
155  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
156  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
157 
158  virtual
159  void
160  resolve_trie_vs_trie(
161  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
162  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
163  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
164  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
165  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
166 
167  virtual
168  void
169  resolve_trie_vs_trie(
170  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
171  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
172  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
173  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
174  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
175 
176  virtual
177  void
178  resolve_trie_vs_trie(
179  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
180  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
181  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
182  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
183  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
184 
185  virtual
186  void
187  resolve_trie_vs_trie(
188  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
189  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
190  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
191  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
192  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
193 
194  virtual
195  void
196  resolve_trie_vs_trie(
197  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
198  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
199  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
200  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
201  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
202 
203  virtual
204  void
205  resolve_trie_vs_trie(
206  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
207  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
208  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
209  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
210  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
211 
212 
213 
214  virtual
215  void
216  resolve_trie_vs_path(
217  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
218  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
219  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
220  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
221  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
222 
223  virtual
224  void
225  resolve_trie_vs_path(
226  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
227  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
228  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
229  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
230  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
231 
232  virtual
233  void
234  resolve_trie_vs_path(
235  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
236  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
237  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
238  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
239  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
240 
241  virtual
242  void
243  resolve_trie_vs_path(
244  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
245  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
246  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
247  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
248  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
249 
250 
251  virtual
252  void
253  resolve_trie_vs_path(
254  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
255  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
256  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
257  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
258  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
259 
260  virtual
261  void
262  resolve_trie_vs_path(
263  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
264  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
265  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
266  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
267  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
268 
269  virtual
270  void
271  resolve_trie_vs_path(
272  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
273  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
274  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
275  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
276  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
277 
278  virtual
279  void
280  resolve_trie_vs_path(
281  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
282  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
283  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
284  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
285  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
286 
287 
288  virtual
289  void
290  resolve_trie_vs_path(
291  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
292  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
293  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
294  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
295  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
296 
297  virtual
298  void
299  resolve_trie_vs_path(
300  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
301  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
302  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
303  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
304  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
305 
306  virtual
307  void
308  resolve_trie_vs_path(
309  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
310  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
311  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
312  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
313  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
314 
315  virtual
316  void
317  resolve_trie_vs_path(
318  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
319  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
320  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
321  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
322  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
323 
324  virtual
325  void
326  resolve_trie_vs_path(
327  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
328  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
329  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
330  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
331  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
332 
333  virtual
334  void
335  resolve_trie_vs_path(
336  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
337  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
338  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
339  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
340  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
341 
342  virtual
343  void
344  resolve_trie_vs_path(
345  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
346  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
347  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
348  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
349  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
350 
351  virtual
352  void
353  resolve_trie_vs_path(
354  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
355  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
356  etable::TableLookupEvaluator const & sfxn,
357  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
358  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
359 
360 
361 
362  //////////////////////////////////// CoarseEtableEnergy /////////////////////////////////
363 
364  virtual
365  void
366  resolve_trie_vs_trie(
367  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
368  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
369  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
370  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
371  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
372 
373  virtual
374  void
375  resolve_trie_vs_trie(
376  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
377  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
378  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
379  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
380  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
381 
382  virtual
383  void
384  resolve_trie_vs_trie(
385  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
386  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
387  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
388  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
389  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
390 
391  virtual
392  void
393  resolve_trie_vs_trie(
394  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
395  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
396  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
397  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
398  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
399 
400 
401  virtual
402  void
403  resolve_trie_vs_trie(
404  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
405  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
406  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
407  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
408  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
409 
410  virtual
411  void
412  resolve_trie_vs_trie(
413  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
414  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
415  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
416  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
417  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
418 
419  virtual
420  void
421  resolve_trie_vs_trie(
422  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
423  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
424  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
425  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
426  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
427 
428  virtual
429  void
430  resolve_trie_vs_trie(
431  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
432  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
433  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
434  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
435  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
436 
437 
438 
439  virtual
440  void
441  resolve_trie_vs_trie(
442  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
443  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
444  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
445  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
446  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
447 
448  virtual
449  void
450  resolve_trie_vs_trie(
451  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
452  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
453  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
454  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
455  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
456 
457  virtual
458  void
459  resolve_trie_vs_trie(
460  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
461  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
462  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
463  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
464  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
465 
466  virtual
467  void
468  resolve_trie_vs_trie(
469  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
470  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
471  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
472  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
473  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
474 
475  virtual
476  void
477  resolve_trie_vs_trie(
478  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
479  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
480  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
481  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
482  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
483 
484  virtual
485  void
486  resolve_trie_vs_trie(
487  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
488  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
489  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
490  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
491  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
492 
493  virtual
494  void
495  resolve_trie_vs_trie(
496  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
497  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
498  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
499  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
500  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
501 
502  virtual
503  void
504  resolve_trie_vs_trie(
505  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
506  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
507  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
508  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
509  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
510 
511 
512  virtual
513  void
514  resolve_trie_vs_path(
515  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
516  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
517  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
518  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
519  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
520 
521  virtual
522  void
523  resolve_trie_vs_path(
524  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
525  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
526  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
527  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
528  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
529 
530  virtual
531  void
532  resolve_trie_vs_path(
533  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
534  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
535  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
536  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
537  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
538 
539  virtual
540  void
541  resolve_trie_vs_path(
542  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
543  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
544  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
545  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
546  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
547 
548 
549  virtual
550  void
551  resolve_trie_vs_path(
552  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
553  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
554  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
555  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
556  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
557 
558  virtual
559  void
560  resolve_trie_vs_path(
561  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
562  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
563  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
564  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
565  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
566 
567  virtual
568  void
569  resolve_trie_vs_path(
570  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
571  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
572  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
573  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
574  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
575 
576  virtual
577  void
578  resolve_trie_vs_path(
579  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
580  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
581  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
582  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
583  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
584 
585 
586  virtual
587  void
588  resolve_trie_vs_path(
589  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
590  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
591  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
592  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
593  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
594 
595  virtual
596  void
597  resolve_trie_vs_path(
598  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
599  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
600  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
601  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
602  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
603 
604  virtual
605  void
606  resolve_trie_vs_path(
607  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
608  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
609  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
610  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
611  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
612 
613  virtual
614  void
615  resolve_trie_vs_path(
616  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
617  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
618  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
619  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
620  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
621 
622  virtual
623  void
624  resolve_trie_vs_path(
625  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
626  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
627  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
628  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
629  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
630 
631  virtual
632  void
633  resolve_trie_vs_path(
634  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
635  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
636  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
637  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
638  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
639 
640  virtual
641  void
642  resolve_trie_vs_path(
643  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
644  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
645  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
646  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
647  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
648 
649  virtual
650  void
651  resolve_trie_vs_path(
652  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
653  trie::RotamerTrie< etable::etrie::EtableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
654  etable::AnalyticEtableEvaluator const & sfxn,
655  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
656  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
657 
658  /// HBONDS
659  virtual
660  void
661  resolve_trie_vs_trie(
662  trie::RotamerTrie< HBAtom, HBCPData > const & trie1,
663  trie::RotamerTrie< HBAtom, HBCPData > const & trie2,
664  HBondEnergy const & sfxn,
665  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
666  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
667 
668  virtual
669  void
670  resolve_trie_vs_path(
671  trie::RotamerTrie< HBAtom, HBCPData > const & trie1,
672  trie::RotamerTrie< HBAtom, HBCPData > const & trie2,
673  HBondEnergy const & sfxn,
674  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
675  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
676 
677  /// Hack Elec Energy
678  virtual
679  void
680  resolve_trie_vs_trie(
681  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
682  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
683  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
684  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
685  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
686 
687  virtual
688  void
689  resolve_trie_vs_trie(
690  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
691  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
692  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
693  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
694  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
695 
696  virtual
697  void
698  resolve_trie_vs_trie(
699  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
700  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
701  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
702  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
703  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
704 
705  virtual
706  void
707  resolve_trie_vs_trie(
708  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
709  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
710  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
711  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
712  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
713 
714  virtual
715  void
716  resolve_trie_vs_trie(
717  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
718  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
719  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
720  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
721  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
722 
723  virtual
724  void
725  resolve_trie_vs_trie(
726  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
727  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
728  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
729  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
730  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
731 
732  virtual
733  void
734  resolve_trie_vs_trie(
735  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
736  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
737  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
738  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
739  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
740 
741  virtual
742  void
743  resolve_trie_vs_trie(
744  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
745  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
746  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
747  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
748  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
749 
750  virtual
751  void
752  resolve_trie_vs_trie(
753  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
754  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
755  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
756  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
757  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
758 
759  virtual
760  void
761  resolve_trie_vs_trie(
762  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
763  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
764  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
765  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
766  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
767 
768  virtual
769  void
770  resolve_trie_vs_trie(
771  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
772  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
773  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
774  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
775  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
776 
777  virtual
778  void
779  resolve_trie_vs_trie(
780  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
781  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
782  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
783  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
784  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
785 
786  virtual
787  void
788  resolve_trie_vs_trie(
789  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
790  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
791  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
792  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
793  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
794 
795  virtual
796  void
797  resolve_trie_vs_trie(
798  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
799  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
800  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
801  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
802  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
803 
804  virtual
805  void
806  resolve_trie_vs_trie(
807  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
808  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
809  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
810  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
811  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
812 
813  virtual
814  void
815  resolve_trie_vs_trie(
816  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
817  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
818  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
819  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
820  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
821 
822  virtual
823  void
824  resolve_trie_vs_path(
825  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
826  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
827  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
828  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
829  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
830 
831  virtual
832  void
833  resolve_trie_vs_path(
834  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
835  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
836  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
837  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
838  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
839 
840  virtual
841  void
842  resolve_trie_vs_path(
843  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
844  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
845  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
846  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
847  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
848 
849  virtual
850  void
851  resolve_trie_vs_path(
852  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
853  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
854  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
855  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
856  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
857 
858  virtual
859  void
860  resolve_trie_vs_path(
861  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
862  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
863  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
864  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
865  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
866 
867  virtual
868  void
869  resolve_trie_vs_path(
870  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
871  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
872  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
873  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
874  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
875 
876  virtual
877  void
878  resolve_trie_vs_path(
879  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
880  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
881  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
882  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
883  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
884 
885  virtual
886  void
887  resolve_trie_vs_path(
888  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
889  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
890  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
891  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
892  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
893 
894  virtual
895  void
896  resolve_trie_vs_path(
897  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
898  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
899  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
900  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
901  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
902 
903  virtual
904  void
905  resolve_trie_vs_path(
906  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
907  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
908  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
909  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
910  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
911 
912  virtual
913  void
914  resolve_trie_vs_path(
915  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
916  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
917  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
918  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
919  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
920 
921  virtual
922  void
923  resolve_trie_vs_path(
924  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
925  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
926  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
927  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
928  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
929 
930  virtual
931  void
932  resolve_trie_vs_path(
933  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
934  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
935  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
936  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
937  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
938 
939  virtual
940  void
941  resolve_trie_vs_path(
942  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
943  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
944  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
945  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
946  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
947 
948  virtual
949  void
950  resolve_trie_vs_path(
951  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
952  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
953  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
954  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
955  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
956 
957  virtual
958  void
959  resolve_trie_vs_path(
960  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
961  trie::RotamerTrie< hackelec::ElecAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
962  hackelec::HackElecEnergy const & sfxn,
963  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
964  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
965 
966  /////////////////////////// MMLJEnergyInter //////////////////////////////
967  virtual
968  void
969  resolve_trie_vs_trie(
970  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
971  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
972  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
973  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
974  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
975 
976  virtual
977  void
978  resolve_trie_vs_trie(
979  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
980  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
981  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
982  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
983  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
984 
985  virtual
986  void
987  resolve_trie_vs_trie(
988  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
989  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
990  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
991  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
992  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
993 
994  virtual
995  void
996  resolve_trie_vs_trie(
997  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
998  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
999  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1000  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
1001  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
1002 
1003  virtual
1004  void
1005  resolve_trie_vs_trie(
1006  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
1007  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
1008  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1009  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
1010  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
1011 
1012  virtual
1013  void
1014  resolve_trie_vs_trie(
1015  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
1016  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
1017  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1018  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
1019  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
1020 
1021  virtual
1022  void
1023  resolve_trie_vs_trie(
1024  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
1025  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
1026  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1027  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
1028  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
1029 
1030  virtual
1031  void
1032  resolve_trie_vs_trie(
1033  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
1034  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
1035  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1036  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
1037  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
1038 
1039  virtual
1040  void
1041  resolve_trie_vs_trie(
1042  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
1043  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
1044  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1045  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
1046  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
1047 
1048  virtual
1049  void
1050  resolve_trie_vs_trie(
1051  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
1052  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
1053  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1054  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
1055  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
1056 
1057  virtual
1058  void
1059  resolve_trie_vs_trie(
1060  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
1061  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
1062  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1063  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
1064  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
1065 
1066  virtual
1067  void
1068  resolve_trie_vs_trie(
1069  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
1070  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
1071  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1072  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
1073  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
1074 
1075  virtual
1076  void
1077  resolve_trie_vs_trie(
1078  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
1079  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
1080  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1081  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
1082  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
1083 
1084  virtual
1085  void
1086  resolve_trie_vs_trie(
1087  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
1088  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
1089  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1090  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
1091  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
1092 
1093  virtual
1094  void
1095  resolve_trie_vs_trie(
1096  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
1097  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
1098  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1099  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
1100  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
1101 
1102  virtual
1103  void
1104  resolve_trie_vs_trie(
1105  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
1106  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
1107  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1108  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & pair_energy_table,
1109  ObjexxFCL::FArray2D< core::PackerEnergy > & temp_table);
1110 
1111  virtual
1112  void
1113  resolve_trie_vs_path(
1114  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
1115  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
1116  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1117  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1118  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1119 
1120  virtual
1121  void
1122  resolve_trie_vs_path(
1123  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
1124  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
1125  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1126  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1127  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1128 
1129  virtual
1130  void
1131  resolve_trie_vs_path(
1132  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
1133  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
1134  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1135  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1136  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1137 
1138  virtual
1139  void
1140  resolve_trie_vs_path(
1141  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie1,
1142  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
1143  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1144  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1145  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1146 
1147  virtual
1148  void
1149  resolve_trie_vs_path(
1150  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
1151  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
1152  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1153  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1154  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1155 
1156  virtual
1157  void
1158  resolve_trie_vs_path(
1159  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
1160  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
1161  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1162  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1163  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1164 
1165  virtual
1166  void
1167  resolve_trie_vs_path(
1168  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
1169  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
1170  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1171  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1172  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1173 
1174  virtual
1175  void
1176  resolve_trie_vs_path(
1177  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie1,
1178  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
1179  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1180  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1181  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1182 
1183  virtual
1184  void
1185  resolve_trie_vs_path(
1186  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
1187  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
1188  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1189  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1190  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1191 
1192  virtual
1193  void
1194  resolve_trie_vs_path(
1195  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
1196  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
1197  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1198  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1199  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1200 
1201  virtual
1202  void
1203  resolve_trie_vs_path(
1204  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
1205  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
1206  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1207  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1208  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1209 
1210  virtual
1211  void
1212  resolve_trie_vs_path(
1213  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie1,
1214  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
1215  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1216  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1217  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1218 
1219  virtual
1220  void
1221  resolve_trie_vs_path(
1222  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
1223  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_1 > const & trie2,
1224  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1225  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1226  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1227 
1228  virtual
1229  void
1230  resolve_trie_vs_path(
1231  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
1232  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_2 > const & trie2,
1233  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1234  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1235  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1236 
1237  virtual
1238  void
1239  resolve_trie_vs_path(
1240  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
1241  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairData_1_3 > const & trie2,
1242  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1243  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1244  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1245 
1246  virtual
1247  void
1248  resolve_trie_vs_path(
1249  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie1,
1250  trie::RotamerTrie< mm::mmtrie::MMEnergyTableAtom, etable::etrie::CountPairDataGeneric > const & trie2,
1251  methods::MMLJEnergyInter const & sfxn,
1252  utility::vector1< core::PackerEnergy > & pair_energy_vector,
1253  utility::vector1< core::PackerEnergy > & temp_vector);
1254 
1255 };
1256 
1257 
1258 } // namespace hbtrie
1259 } // namespace hbonds
1260 } // namespace scoring
1261 } // namespace core
1262 
1263 #endif
Generated on Sat Jun 1 2013 11:37:21 for Rosetta 3.5 by   doxygen 1.8.4